Es el año 2000, último año del siglo XX. El primer Angel ataca la tierra, ser de grandes dimensiones, casi imposible de derrotar. Este hecho se conoce como "El primer Impacto".En territorio antártico, es encontrado un huevo de Angel. Este huevo, es denominado ADAM. La explosión de éste, provoca un gran caos en la tierra, lo que casi provoca la extinsión de la raza humana, hecho conocido historicamente como "El Segundo Impacto". Desde entonces, se crea NERV, una división de las Naciones Unidas encargada de proteger a la tierra ante un eventual segundo ataque de los Ángeles. Años más tarde, se crea el prototipo de lo que se conoce como Evangelion, unidad 00. Evangelion es un gran ser, aparentemente un robot, piloteado por una persona, encargado de proteger a la tierra de un eventual ataque de los Ángeles. Esta unidad, es piloteada por Ayanami Rei, conocida como el "First Children".Más tarde, en el año 2015, entra en acción EVA01, piloteado por el "Second Children" Ikari Shinji, hijo del Comandante Ikari, uno de los integrantes del directorio de NERV. La serie se desarrolla desde el momento en que Ikari Shinji llega hasta las dependencias de NERV, para formar parte de la misma, momento en el cual el segundo Angel ataca la tierra.