Από τα πανάρχαια χρόνια οι Κουφονησιώτες ασχολούνται με την αλιεία τόσο, για να επιβιώσουν όσο και για να κερδίσουν χρήματα. Υπάρχουν διάφορα είδη ψαρέματος στο νησί και μεγάλη ποικιλία εργαλείων.
Για το ερασιτεχνικό ψάρεμα χρησιμοποιούνται "οι συρτές", ένα νήμα δηλαδή, που στην άκρη του έχει ένα αγκίστρι. Το δόλωμα πολλές φορές είναι ένα ψεύτικο ψάρι που παρασύρει τα ψάρια.
Ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρουσιάζει το υποβρύχιο ψάρεμα που γίνεται με "ψαροτούφεκο". Χρειάζεται απλώς ένα βέλος ή ένα καμάκι, το οποίο τρυπά τα ψάρια.
Άλλο επίσης ενδιαφέρον είδος ψαρέματος είναι το "πυροφάνι" . Το "πυροφάνι" είναι το φως της λάμπας που βρίσκεται στην πλώρη της βάρκας και προσελκύσει τα ψάρια.
Το επαγγελματικό ψάρεμα προσφέρει μεγαλύτερο κέρδος. Τέτοιο ψάρεμα είναι το "γρι-γρι", ένα μεγάλο δίχτυ που φωτίζεται με λάμπες από τη βάρκα . Το φως της λάμπας τραβά την προσοχή των ψαριών και εκείνα έρχονται προς το δίχτυ. Οι περισσότεροι ψαράδες δουλεύουν την τράτα και τα δίχτυα. Η τράτα, το δίχτυ και το "γρι-γρι" είναι οι πιο προσοδοφόροι τρόποι ψαρέματος, γιατί το δίχτυ φτάνει έως τα βαθιά, όπου υπάρχουν πολλά ψάρια. Στο επαγγελματικό ψάρεμα συνεργάζονται 4-5 άτομα, γιατί χρειάζονται χέρια, για να βγάλουν τα ψάρια και να τα συντηρήσουν καλά, ώστε να τα πάνε στην αγορά φρέσκα.
Άλλο είδος ψαρέματος είναι "το παραγάδι" που αποτελείται από ένα πανέρι (καλάθι) με νάιλον κλωστή και πάρα πολλά αγκίστρια γύρω από ένα φενιζόλ, κολλημένο πάνω στο παραγάδι. Το παραγάδι έχει πάνω από 200 αγκίστρια και ρίχνεται στα βαθιά. Μετά από 5-6 ώρες ανασύρεται στην επιφάνεια με τα ψάρια.
Οι ψαράδες του νησιού χρησιμοποιούν επίσης διάφορα είδη διχτύων, τα "γουπόδιχτα", τα "αστακόδιχτα", "τα ατερνόδυχτα" Τα παιδιά του νησιού συνηθίζουν το "τρατί". Σ' αυτό το ψάρεμα παίρνουν μέρος 5-6 άτομα πάνω σε μια βάρκα. Τα παιδιά ρίχνουν το μικρό δίχτυ, το "τρατί", όπου υπάρχει πολύ ψάρι. Δένουν τις άκρες του και περιμένουν. Μετά από λίγη ώρα το τραβάνε έξω και παίρνουνε τα ψάρια.
