在前往魚人島的路上，魯夫撿到一個寫有「海神域寶前」的祭神酒桶，一行人迫不及待的想一探究竟，誰知道才一打開來， 酒桶裡立刻噴出一道詭異的紅光並直射向天空，羅賓認為這其中必有隱情。接著他們因為遭遇暴風雨而來到一片被濃霧包圍的海域，這裡就是前往魚人島的必經之路「魔鬼三角地帶」，在那裡，他們遇見了活生生的骷髏人紳士－布魯克，還有意想不到的敵人正虎視眈眈的等待著他們。
然而騙人布、喬巴和娜美卻不小心誤入了鬼魂島，被島上的殭屍軍團追殺。船上剩下的人也遭不明人物偷襲。為了查明原因，一行人展開了一場鬼魂島的冒險，娜美三人組在誤打誤撞的情況下，來到傳說中的天才外科醫生－Dr.豪格巴克的宅邸，沒想到宅邸內也出現了一大批的殭屍，他們更發現了豪格巴克原來就是創造這些殭屍的主謀，另ㄧ方面魯夫也帶領其他四個人，浩浩蕩蕩的闖了進來，從某位和布魯克一樣失去影子的老人口中得知，這個鬼魂島的真面目竟是艘恐怖三桅帆船，而船上的統治者為王下七武海的「月光·莫利亞」以及旗下的三怪人。
進入宅邸後事件果然發生，夥伴們相繼失蹤，強大的殭屍陸續出現在他們眼前，有的殭屍竟然會用索隆和香吉士的的招式，最後連身為最強戰力的魯夫也落入敵人之手，倖存的佛朗基和羅賓則在骷髏人布魯克的幫助下逃過ㄧ劫，布魯克提供了他們許多關於莫利亞的情報、殭屍利用別人的影子誕生的秘密、弱點及他ㄧ段不為人知的過去，而被抓住的魯夫也和莫利亞見面了，摩利亞以「影子果實」能力奪去了魯夫的影子，魯夫則失去意識被殭屍丟回千陽號上。
以魯夫影子為動力，500年前建立「力拔王國」傳說的特別僵屍「歐斯」終於從沉睡中甦醒過來，正巧被躲在殭屍布偶裡的娜美三人組目擊了此景但也被敵人發現，三人立即使力逃跑，娜美卻被看上她的三怪人之-阿布薩羅姆給抓走了，騙人布喬巴在遭受殭屍攻擊之際，終於佛朗基羅賓兩人會合，回到千陽號上，他們喚醒了失去影子的魯夫、索隆和香吉士，佛朗基將他和布魯克談過的整件事經過都告訴魯夫，得到了令他震驚的消息，原來布魯克竟然是當時在雙子峽遇到的大鯨魚拉布的夥伴之ㄧ，魯夫一行人於是決定在重返鬼魂島，帶著能將殭屍淨化的鹽球，除了要奪回ㄧ切外，還要讓布魯克成為他們的夥伴，在天亮之前，這場戰鬥將決定草帽海賊團和其他沒影子犧牲者的命運。
回到鬼魂島上，ㄧ行人成功擊倒了三怪人，並讓布魯克的影子重回他的腳下，索隆順利得到新刀「秋水」，娜美也在阿布薩羅姆的婚禮計畫中逃脫，並回歸戰鬥隊伍，此時同樣為王下七武海的「巴索羅謬·大熊」突然光臨鬼魂島，並說出前來的目的是受世界政府之命，為了幫助莫利亞，免於成為第二個被打敗的七武海，憤怒的摩利亞為了向大熊和世界政府的五老星證明自己的實力，絕對不可能敗給草帽海賊團，於是親自出馬，他操控魯夫的殭屍歐斯發動攻勢，在歐斯壓倒性的強大力量下，夥伴們ㄧ個個都被擊倒，魯夫除外的ㄧ行人陷入了苦戰，眼見草帽海賊團就要全軍覆沒了，千均ㄧ髮之際出現在同伴面前並且擋住歐斯攻擊的，是得到100個影子力量的「夢魔魯夫」，殭屍魯夫和夢饜魯夫，兩個魯夫的對決就此展開。
「夢魔魯夫」是羅林海賊團等人還有其他同樣被莫利亞奪走影子的海賊們發現，他們發現其實其他人被莫利亞奪走的影子可以塞進別人的身體裡並且可以獲得這原主人的能力，但是只能維持十分鐘，而且被塞影子的人必須要有相當強的精神力，不然就會昏過去並且失去效用，本以為歐斯和摩利亞認為「夢魔魯夫」沒什麼，歐斯一拳過去卻被魯夫一手擋了下來，接著魯夫十分鐘之內把歐斯和摩利亞海扁了一頓，十分鐘過後塞在魯夫身體裡的100個影子也回到原本主人身邊。
本以為事情可以解決，結果歐斯還沒有倒下，但是天快亮了，羅林海賊團的船員開始萌生退意準備退回森林時，魯夫海賊團全體成員一個個站起來並把歐斯再一次打倒並準備把在歐斯肚子裡操縱歐斯的摩利亞讓他把影子歸還原主，結果摩利亞卻自己起來並且把鬼魂島內1000份的影子(包含魯夫、索隆、香吉士還有羅賓)利用「影子集合地」全部吸到自己體內，此時天空已經開始亮起來，代表那些被搶走影子的海賊快沒有時間了，而羅林海賊團的船員也準備退回森林只剩羅林海賊團船長羅拉願意留下，與時間賽跑的魯夫海賊團面對是他們先消失還是莫利亞先自行毀滅，而魯夫也用2檔面對，莫利亞直接對於魯夫開始展開攻擊，魯夫也不甘示弱攻擊莫利亞的肚子，而魯夫每攻擊一次莫利亞就「吐」出影子，莫利亞利用「碎片蝙蝠」形成的「影箱」把魯夫關起來後便想把魯夫打扁，本以為魯夫就此戰敗，結果魯夫卻站起來說：「誰也別想揍扁我！」莫利亞說：「『別想揍扁你？！』你哪來的自信說出這種話...越大言不慚越顯現出你的軟弱...」魯夫卻說：「因為我是「橡膠人」，便啟動魯夫最強攻擊「 骨氣球 橡膠之巨人的噴射砲彈」讓莫利亞要所吸收的影子吐出來，摩利亞本想用手擋著但是影子最後還是全部出來了，此時已經日出了，在千鈞一法之際影子歸回身體，使魯夫一行人的身體沒被太陽燒死，羅林海賊團和所有影子犧牲者們向魯夫海賊團表達深深的謝意，就在眾人以為惡夢終於結束之時，娜美這才突然想到那件重要的事，就在這時，王下七武海之ㄧ的-「暴君」巴索羅謬·大熊突然現身，並且用電話蟲告知世界政府的「五老星」，王下七武海的「月光•莫利亞」已被草帽海賊團打敗，雖然王下七武海之ㄧ的「月光·莫利亞」被草帽海賊團打敗，但是「五老星」因情勢所逼，還是決定要讓「月光•莫利亞」繼續當任王下七武海，而世界政府為了粉飾太平，立刻對「巴索羅謬·大熊」下一道特令- <殲滅恐怖之船上的草帽小子一夥人與目擊者> ,此時「巴索羅謬·大熊」決定先找羅羅亞.索隆先開刀。索隆先發制人，但所有的攻擊都對大熊無用，原來巴索羅謬·大熊是個擁有「肉球果實」能力的肉球人，能夠將一切東西都彈飛，他向魯夫海賊團提出「只要交出草帽魯夫就免你們一死」的條件，但在眾人拒絕的情況下，巴索羅謬·大熊立即使出強大招式「熊的衝擊」，將恐怖之船炸毀了。
主要新角色: