El Lago de Güija compartido entre Guatemala y El Salvador, a sido habitado desde la epoca precolombina.
Durante alrededor del preclasico medio empezo hacer habitado fue ocupado como un sitio tanto ceremonial como residencial, astrologico y astronomico;
convirtiendose en el sitio mas importante en la zona norte del rio lempa en El salvador.

En el año 250 despues de cristo, hace erupcion el lago de ilopango provocando el abandono de los sitios del lago, no obstante no todos los sitios fueron abandonados, algunos continuaron siendo habitados, estos sitios se vieron influenciados grandemente por Teotihuacan y Copán y hicieron comercio hasta con poblaciones en el peten guatemalteco y Costa Rica, esto queda evidenciado en la denominado Placa del Lago de Guija, un pedazo grande de jade en donde su parte de lantera esta la pintura de un hombre de gran importancia (un gobernante o sacerdote) y en su parte de atras glifos mayas.

En el año 600 despues de cristo vuelven aser ocupados las otras partes del lago; en donde se levantan sitios que serian ocupados hasta la conquista española, en estos sitios se encuentran:petrograbados,murallas,piramides y zonas residenciales),estos sitios son:Azacualpa,Isla Teotipa,llano Guajoyo,San Diego,Belen Guijat y Igualtepeque. De todos ellos en Igualtepeque, se levanto una terraza artificial con piedra y tierra y sobre ella se levantaron plataformas que sostuvieron estructuras, y sobre la cima del cerro Igualtepec se levanta una piramide y en la base de la misma se encuentraron petrograbados (grabados en piedra) con mas de 100 representaciones de dioses, animales, figuras antropomorfas, objetos y representaciones de caracter astronomico y astrologico.

Durante el posclasico se dice que el emperador tolteca Ce Acatl Topiltzin Quetzalcoatl fundo un santuario al diosa Nuictlan, este se convirtio en un sitio ceremonial importante para los Chortis y un sitio ceremonial y de peregrinacion para los pipiles y otros pueblos cercanos, el cronista oidor Garcia Palacios que visito el santuario nos escribio como eran la estructura religiosa, la ceremonias y la religion de los pipiles; nos los dejo escrito en sus carta al rey de España; el lago de guija seria ocupado como sitio ceremonial precolombino hasta la colonizacion española.