Ubuu (el chico de color) entrena con Goku. Goten y Trunks ahora son adultos, Pan tiene 14 años. Kryllin tiene ahora pelo canoso. Pilaff después de muchos años finalmente a logrado juntar las Esferas de el Dragón para pedir la dominación de el mundo. Shenlong ya apareció cuando Goku llega para evitar el deseo de Pilaf, Pilaf al ver a Goku tan grande después de todos estos años dice que desearía que Goku siguiera siendo un niño para que fuera mas fácil vencerlo, Sheng Long toma esto como un deseo y Goku vuelve a ser niño, Pilaff sale corriendo (ha,ha) y no es vuelto a ver. Goku regresa Kame House y les cuenta a todos lo que paso, Mr. Popo aparece y les dice a todos acerca de unas Esferas del Dragón negras, les dice que estas están repartidas en el espacio, Goku decide ir a buscar estas esferas de el dragón para poder volver a ser grande (las Esferas de la tierra solo pueden ser usadas una vez por año). Después Mr. Popo menciona que las Esferas tienen que ser juntadas antes de que pase un año debido a una desestabilidad de la tierra por la cual dentro de un año explotara (¡qué!). Goku y Trunks suben a la cápsula espacial, Pan se escabulle abordo sin que se den cuenta y por accidente daña una de las turbinas de la nave espacial. La nave espacial se estrella en diversos planetas. En estos planetas nuestros héroes van juntando las Esferas de el Dragón, también conocen a una serie de personajes (por cierto de baja calidad) .

Durante estos capítulos Goku y Trunks se vuelven Super Sayajins por primera vez en Dragon Ball GT para pelear contra villanos menores. Pan también pelea pero pasa mas tiempo viendo a Goku y a Trunks pelear. Después nuestros héroes conocen a Gill, un pequeño robot que se trago el radar del dragón por lo cual se une a nuestros amigos en su aventura. Nuestros héroes aterrizan en el planeta de Dr. Myuu. Dr. Myuu es un malvado científico que crea robots y Cyborgs peleadores. Gill es una de sus creaciones. Trunks es raptado, Pan intenta rescatar a Trunks mientras Goku pelea con Ruudo. Ruudo es matado y Gill ayuda a Trunks y a Pan escapar y nuestros héroes regresan al espacio. Uno de los proyectos de Dr. Myuu es Baby. Baby es el único Tsufuru-jin que queda vivo (los Tsufuru-jins eran los habitantes de el planeta Veyita antes de que los Sayajins aterrizaran). Baby quiere tomar venganza sobre los Sayajins debido a que ellos aniquilaron a toda su raza. Dr. Myuu encontró a Baby y lo rescato, Baby tiene el poder de tomar los cuerpos y su poder. Baby toma el cuerpo de Dr. Myuu y lo mata en traición. Trunks, Goku, Pan y Gill finalmente regresan a la tierra con las 7 Esferas del Dragón negras y se las llevan a Popo quien las guarda para usarlas después.

Mientras tanto Baby aterriza en la tierra y poco a poco va tomando los cuerpos de Trunks, Gohan y Goten y dejando un huevo en su cabeza, este huevo hace a la persona a un zombie de Baby. (Cuando Gohan era Gohan-Baby lastima a Piccolo con un poder). Baby por fin encuentra un cuerpo lo suficientemente poderoso para el, el de Vegeta. El cuerpo de Vegeta es tomado y Vegeta-Babi es formado, Pronto todos se convierten en zombies de Baby y usa las Esferas del Dragón negras para formar otro planeta Plant (Plant era el nombre de el planeta donde los Tsufuru-jins vivían antes de que los Sayajins lo invadieran y lo llamaran Veyita). Pronto todos se convierten en zombies de Baby excepto Sataan, Pan, Boo, Ubuu y Goku. Mr. Popo como Zombie de Baby y usó las Esferas para hacer un nuevo planeta Plant (es aquí donde la serie de Dragon Ball GT comienza a tener éxito y a satisfacer a los fans de Dragon Ball). Ubuu pelea contra Vegeta-Baby y es derrotado, Boo se une a la pelea y es liquidado, el espíritu de Boo entra en Ubuu y se fusionan, Ubuu se entera de que el y Boo eran originalmente uno, pero incluso con esta fusión Ubuu no es reto para Vegeta-Baby. Ahora es el turno de Goku para enfrentar a Vegeta-Baby. Vegeta-Baby es muy superior al pequeño Goku.

Gokou se convierte en Super Sayajin 3, peroaún así es derrotado. Vegeta-Babi también puede alcanzar SSJ3. Pan esta escondida en el fondo y observa la pelea, Goku es derrotado y es retirado de la pelea por Kaioo-shin. En el planeta de Kaioo-shin, los habitantes de el planeta están preparando una fórmula para que le vuelva a crecer la cola a Goku (la cola es la principal fuente de poder de un Sayajins. La cola de Goku vuelve a crecer pero sólo a la mitad, Kaioo-shin la jala para que esta recobre su tamaño normal. Goku vuelve al planeta Plant para enfrentar a Vegeta-Baby, después de ser derrotado de nuevo por Vegeta-Baby, después de eso Goku se convierte en Oozaru (mono gigante) dorado (el dorado es debido a que en vez de ver la luz reflejada en la luna este la ve reflejada en la tierra la cual es mucho mas grande). En esa forma Goku destruye todo y después otro cambio sucede, Gokou obtiene el control de su cuerpo y entra a otra etapa. Se convierte en Super Sayajin Goku 4. Goku le da la vuelta a la pelea y ahora Vegeta-Baby esta perdiendo la pelea. Bulma la cual esta convertida es zombie de Baby crea un lente para su esposo. Este lente hace ver mas grande la tierra y Vegeta-Baby se convierte en Oozaru. Goku es derrotado de nuevo. Mientras tanto Kaioo-shin encuentra que un agua especial llamada Choo-sui la cual puede liberar a la gente de el control se Baby.

El va al palacio de el cielo y recoge esta agua, Kaioo-shin les echa esta agua a Mr. Popo y a Dende y estos se la esparcen a todos. Trunks, Gohan, Goten y Pan rodean a Gokou y su energía es donada a el, Gokou hace un Kamehameha y derrota a Vegeta-Baby. Baby deja el cuerpo de Vegeta y escapa al espacio en una nave espacial pero es destruido. La tierra esta a punto de explotar debido a que el deseo de que se estabilizará no fue pedido, nuestros héroes transportan a los habitantes al planeta Plant, Piccolo decide quedarse en la tierra por su gran amor al planeta por lo cual muere con ella. La tierra explota junto con Piccolo. En Nameck las esferas son reunidas y se pide que la tierra sea reconstruida, pero de todos modos Piccollo sigue muerto porque ya se había pedido que reviviera en Dragon Ball GT, Goku ahora esta en una etapa de poder, la paz vuelve a la tierra...