1. Pionierformationen mit Meereseinfluss (Restinga) 

Ein grosses Gebiet der Insel ist von diesem Vegetationstyp, der eine grosse Variationsbreite in Physionomie und Flora aufweist, bedeckt. Im allgemeinen findet man ihn auf sandigem Substrat oder steinigen Landzungen der Hügel und er leidet unter direktem Meereseinfluss. Man schließt hier eine grosse Varietät von Pflanzengemeinschaften ein: die der Strände, der Dünen, strauchige Vegetation im Anschluss an die Strände, trockene Wälder, sumpfige Wälder, etc.  
 

2. Pionierformationen unter Süßwassereinfluß 

Hierbei handelt es sich um Pflanzengemeinschaften der Flußebenen, die die Auswirkungen der Überschwemmungen während der Regenzeiten wiederspiegeln, oder auch solche, die sich in Depressionen befinden, die das ganze Jahr über Überschwemmungen ausgesetzt sein können.  
Auf der Insel findet man diesen Vegetationstyp in Form von Sümpfen mit Kräutern oder Bäumen, die sich in den Depressionen zwischen den Küstengürteln befinden. 

3. Pionierformationen mit Fluss/Meereseinfluss (Mangrovenwälder und Salzfelder) 

Diese Gemeinschaften findet man im brackigen Umfeld der Fluß- und Bachmündungen ins Meer, wo sich eine spezialisierte Vegetation ausbildet, die an salzhaltiges Wasser angepasst ist. 
Die größten Mangrovengebiete befinden sich im nordwestlichen Teil der Insel, um die Mündungen der kleinen Flüsse der Küstenebene herum, und am Saco do Limeiro. 

4. Dichter Regenwald der Tiefländer 

Dieser Vegetationstyp besiedelt im allgemeinen Küstenebenen, vom Amazonasgebiet bis hin nach Rio Grande do Sul. Ab dem Bundesstaat São Paulo, nach Süden hin, dominieren zwei Baumarten, Calophyllum brasiliense und Ficus organensis.  
Auf der Ilha do Mel findet man diese Gemeinschaft hauptsächlich in der Ebene des nördlichen Teils. 

5. Submontaner dichter Regenwald  

Normalerweise findet man diese Waldgemeinschaft in den Einschnitten der Gebirge und der Hochebenen, auf mittelmässig ausgebildeten Böden. Typisch ist, daß die Bäume eine mehr oder weniger einheitliche Höhe haben. Der Unterstand wird durch Naturverjüngungspflanzen, Palmen und krautigen Lianen in grösserer Anzahl gebildet. 
Die Hügel des südöstlichen Teils der Insel, der Morro do Meio, Morro do Miguel und Morro Bento Alves und der Morro da Baleia im westlichen Teil, sind von diesem Waldtyp bedeckt. Spuren menschlicher Eingriffe sind überall festzustellen. 

6. Sekundärvegetation 

Wenn die, hauptsächlich für die Landwirtschaft, entwaldeten Flächen  im Stich gelassen werden, werden sie von Sekundärvegetation  bedeckt. 
Je nach dem Sukzessionsstadium (anfang, mittel, fortgeschritten) findet man capoeirinha, capoeira e capoeirão. 
 

Man findet eingie Pflanzenarten, die im Bundesstaat Paraná von der Ausrottung bedroht sind, im Gebiet der ökologischen Station. Voyria Aphylla und Calyptrantes rubella werden als selten angesehen, und Neomitranthes glomerata ist von der Ausrottung bedroht. 
 
 

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