Conservar amostras de ecossistema marinho excepcionalmente rico em recifes, algas e ictiofauna e proteger espécies ameaçadas de extinção, principalmente as tartarugas marinhas, baleias jubarte e coral cérebro, conciliando a proteção integral da flora, da fauna e das belezas naturais com a utilização para objetivos educacionais, recreativos e científicos.

A unidade era anteriormente uma área de pesca. Nela existe um antigo farol da Marinha, mas devido às dificuldades de navegação entre os corais existentes no arquipélago, ocorriam um grande número de naufrágios. Antigas referências reportadas por historiadores, relatam que navegantes portugueses recebiam a advertência "Abram os Olhos" pelo perigo de se navegar por essa região. Daí vem o nome Abrolhos, arquipélago que sempre foi ponto de referência para os navegantes.

Possui uma área de 88.249 ha. Está localizado no litoral sul da Bahia e o acesso pode ser feito de lancha (2,5 horas), de traineira (4 horas) ou de escuna (6 horas), partindo-se de Caravelas, cidade mais próxima da unidade, que fica a 33 milhas náuticas do Parque e a 950 km da capital do estado, a qual o acesso pode ser feito através da BR-101/BA-101.

O parque apresenta excelentes áreas para mergulho autônomo e livre, pois as formações de corais abrigam grande diversidade de fauna marinha. Nas ilhas, a atração fica por conta das aves nidificando nas formações rochosas. Paga-se pelo ingresso e o Parque é aberto todos os dias. Diversas embarcações oferecem passeios de um dia ou mais. A partir de julho, inicia-se a temporada das baleias jubarte. 

Há grande diversidade de fauna marinha, com inúmeras espécies de peixes, moluscos, corais, esponjas, entre outras. Para a fauna terrestre, destaca-se as aves que se reproduzem nas ilhas: atobás, trinta-reis, fragatas, grazinas e o benedito, principalmente. 

Excesso de turistas e mergulhadores têm causado destruição aos corais e modificado as características da água. A navegação constante também traz poluição e risco de acidentes. Além disso, muitos pescadores buscam a região para exercerem suas atividades sem controle. 

Áreas de reprodução de peixes protegida; pontos de lazer e mergulho e renda para a população do entorno (Caravelas, Alcobaça e Prado) que trabalham com atividades de turismo. 

Plano de Manejo elaborado em 1991 e Plano de Ação Emergencial elaborado em outubro de 1995. O projeto Baleia Jubarte vem sendo desenvolvido há 8 anos, trazendo informações valiosas para a preservação e manejo da espécie, o que deu origem ao Instituto Baleia Jubarte (ONG). 

Uma casa de apoio na ilha de Santa Bárbara; uma sede em Caravelas e uma instalação que atualmente apóia as atividades do projeto Baleia Jubarte (180 m2); duas sedes de 70 m2 cada; um centro de visitantes; uma Pickup F-1000 (1991); uma Mercedes Van (1996); um Fiat Uno (1997); uma traineira de 45 pés; quatro motores de popa de 15 HP e um motor de 25 HP; sistema de comunicação (telefone e fax; quatro rádios VHF e dois SSB); rede elétrica (gerador) e hidráulica (cisterna).