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O QUE É O MÉTODO SHOTGUN DE SEQUENCIAMENTO DE DNA?
-A principal diferença entre o sequenciamento “shotgun” e o sequenciamento
tradicional é que no método tradicional o DNA era analisado aos poucos.
Pedaços do genoma de um organismo eram duplicados, cortados em pedaços ainda
menores, colocados em um gel de eletroforese e então seqüenciados. O
processo era então repetido novamente até que, de pedaço em pedaço, todo o
genoma era seqüenciado.
Esse processo tradicional, obviamente, levava muito tempo.
-No método “shotgun”, por outro lado, grandes quantidades DNA, eventualmente
todo o genoma de um organismo, é analisado simultaneamente o que torna o
processo muito mais rápido. O genoma do organismo é todo duplicado (clonado)
e cortado em pequenos pedaços que são seqüenciados. O grande desafio do
método shotgun são os computadores muito poderosos necessários para
organizar a gigantesca “bagunça” das combinações possíveis de todos as
pequenas seqüências em um único genoma coerente. É como picotar um livro de
milhares de páginas em um monte de recortes de frases e depois ter que
montar tudo de volta na forma de um livro que faça sentido. É por isso que o
sucesso do método shotgun se deveu mais ao desenvolvimento de novas técnicas
computacionais do que a descoberta de um novo método bioquímico de
sequenciamento.
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