As Estações de Trabalho diferem significamente do microcomputadores em dúas áreas.Internamente, as estações de trabalho são construídas diferentemente dos microcomputadores. Em geral, elas se baseiam em uma outra filosofia de projeto de CPU chamada de RISC (Reduced Instruction Set Computing - Computação em Conjunto Reduzido de Instruções), que resulta em um processamento mais rápido das instruções.
A outra diferença entre as Estações de Trabalho e os microcomputadores é que a maioria dos micros roda qualquer um dos maiores sistemas operacionais - DOS, UNIX, OS/2, e Microsoft Windows (e o Macintosh também roda o sistema operacional Macintoshe a versão Unix da Apple, A/UX) - ,mas geralmente todas as Estações de Trabalho rodam o sistema operacional Unix ou uma variação dele. O maior fabricante de Estações de Trabalho é a Sun Microsystems. Outros fabricantes incluem IBM, DEC, Hewlett-Packard(HP), NeXT e Silicon Graphics.
Uma advertência: muitas pessoas usam o termo Estação de Trabalho para fazer referência a qualquer computador ou terminal ligado a outro computador. Embora esse uso tenha sido um dia comum para o termo, agora está obsoleto. Hoje Estação de Trabalho é um potente computador baseado na arquitetura RISC que roda o sistema operacional Unix.