Tudo começa num dia descontraído no orfanato, até Makoto resolver correr atrás de seu avião de brinquedo em meio aos carros que passam velozmente pela rua No orfanato: A tragédia seria consumada caso Hyoga não aparecesse para deter um carro que iria de encontro ao pequeno Makoto. Shun e Seiya distraem a criançada enquanto rola a maior paquera entre Hyoga e Eiri, ajudante de Minu na instituição. Já a noitinha, Hyoga e Eiri vão ao cais para se conhecerem melhor. Durante sua conversa com a bela moça loira, o Cavaleiro de Cisne se deslumbra com uma estrela cadente. Esse era o presságio para os eventos que viriam logo em seguida. De dentro da estrela que rasgava os céus foi jogado um objeto: uma maçã de ouro.
Instantaneamente os olhos da meiga Eiri se petrificaram. Hyoga se despediu da moça e foi se recolher, mas ela seguiu em direção da "maçã cadente". Finalmente a maçã toca o solo de uma montanha onde se ergue o Santuário da deusa da discórdia. Eiri, hipnotizada, segue em direção ao Santuário. A cada passo a essência de deusa domina seu corpo. Em meio ao bosque surge Saori cavalgando ligeiramente ao encontro de Eiri. Ao encontrá-la, a líder dos Cavaleiros de Bronze tem uma surpresa, aquela meiga moça de outrora já havia sido totalmente incorporada por Éris. A deusa má quebra a perna do cavalo branco em que Saori cavalgava. Ela, então é levada para o novo Santuário das Trevas. Éris, já em seu santuário, prende Saori em um tipo de cruz de pedra e atira junto ao coração da deusa Athena a maçã de ouro. Essa maçã não é fincada no peito de Saori porém, ela tem o poder de drenar as forças da deusa da sabedoria.
O novo desafio Éris, ao lançar sua maçã de ouro contra o coração de Saori, enviou também um desafio para os Cavaleiros: eles teriam de proteger sua líder. Para tanto, Éris mandou junto com o desfio a localização do novo Santuário. A Deusa ressuscita os temidos Cavaleiros Fantasmas, seus servos e seguidores. São eles :Jaga de Orion, Orfeu de Arpa, Kraisto do Cruzeiro do Sul, Yan de Escudo e Maya de Sagita. Assim sendo os Cavaleiros partem em direção do santuário da deusa Éris.
Maya X Seiya: No pé da montanha, onde se localiza o Santuário de Éris, o Cavaleiro fantasma Maya de Sagita encontra Seiya de Pegasus. Tem início o combate. Maya e Seiya trocam golpes no ar. Como não há muito tempo o Cavaleiro de Pegasus tem que agir rapidamente. Seiya ataca Maya que se utiliza de seus poderes fantasmagóricos e se multiplica para que os meteoros de Pegasus dissipem sua força. O Cavaleiro fantasma prepara seu contra-ataque. Os golpes de Maya são centenas de flechas fantasmas que se materializam. Seiya é jogado para trás pela força do ataque do Cavaleiro de Sagita, que mira suas flechas na cabeça de Seiya novamente, desta vez o defensor de Athena é mais ligeiro e anula as flechas fantasmas com seus meteoros até atingir seu adversário. O Cavaleiro fantasma é vencido, mas Seiya acaba sendo atingido por uma das flechas da Maya bem abaixo do coração. O ferimento não parece ser muito grave e o Cavaleiro de bronze prossegue na sua busca.
Hyoga X Kraisto: O Cavaleiro de Cisne encontra uma entrada por baixo do Satuário. Ao entrar pela passagem, chega a um anti-cômodo abaixo do Templo de Éris. Lá, encontra mais um dos Cavaleiros fantasmas: Kraisto de Sazankroz. Não há tempo para ficar conversando e os dois Cavaleiros partem logo para a briga. Hyoga aplica seu Pó de Diamante, ao mesmo tempo que Kraisto ataca com seu Trovão do Cruzeiro do Sul. O golpe de Kraisto vara o peito da Armadura de Cisne. Mesmo atingido, Hyoga consegue congelar seu inimigo até o pescoço. Quando o Cavaleiro de bronze se preparava para eliminar o Cavaleiro fantasma, surge Éris com seu tridente incandescente. Cisne fica perplexo ao reconhecer Eiri. Infelizmente quem estava a sua frente era a perversa Éris. Enquanto Hyoga ainda estava em estado de choque, Kraisto se livra do gelo que recobria seu corpo, joga o defensor de Athena longe e já pula para cima dele. Para a surpresa de todos, Éris ataca seu tridente que perfura o Cavaleiro fantasma pelas costas até rasgar o peito de Cisne, supostamente matando os dois. E então Éris abandona o local deixando o corpo dos dois Cavaleiros.
Shiryu X Yan: Seiya continua sua subida até onde está Saori, mas o Cavaleiro começa a sentir os efeitos da Flecha de Sagita que o atingiu. Seiya está meio tonto, desnorteado, mas segue em sua caminhada. Em outro local do Santuário de Éris é a vez de Shiryu enfrentar o Cavaleiro fantasma Yan de Tateza. Esse Cavaleiro se parece muito com o Cavaleiro de Dragão. Yan tem cabelos longos e sua Armadura de Tateza dispõe de um podEoso escudo. Começa a luta. O escudo de Yan se mostra poderoso, pois logo no primeiro ataque de Shiryu seu punho acaba sendo destruído. Em seguida Yan dá uma giratória que despedaça o escudo do dragão. Shiryu tira a Armadura dando a Yan a certeza da vitória, mas o Cavaleiro do dragão surpreende seu adversário ao aplicar-lhe o Cólera do Dragão. Shiryu atravessa o coração do Cavaleiro fantasma que cai morto.
Shun X Orfeus: O Cavaleiro de Andrômeda continua escalando as ruínas do Santuário. Shun é atraído pela música de uma harpa. É Orfeus de Arpa que toca o instrumento musical à espera do Cavaleiro de bronze. Enquanto Shun fica parado, Orfeus ataca. Seu golpe é disparado através das cordas de sua harpa, que se multiplicam e atacam o Cavaleiro de Athena. Quando Shun está prestes a morrer degolado surge Ikki para salvar a pelo do irmão. Orfeus irrita o Cavaleiro de Fênix que o aplica o Golpe Fantasma de Fênix que causa horrendas alucinações - o Cavaleiro de Arpa se vê queimando vivo. Para a surpresa de Ikki, Orfeus se restabelece e explica que o golpe de Fênix não surte efeito nele, pois ele é um Cavaleiro fantasma. Então Ikki ataca com seu Asas de Fênix e então o Cavaleiro fantasma é derrotado.
O encontro com Éris Seiya chega até a sala onde Saori está presa. Lá está Éris que agora se materializa em seu próprio corpo e dispensa o da meiga Eiri que cai desacordada. O Cavaleiro de Pegasus continua sofrendo com o ferimento feito por Maya e pior, ele terá que vencer mais um Cavaleiro fantasma, Jaga de Orion. Se inicia mais uma luta. Seiya não tem a visão perfeita por causa da flecha de Maya, o Cavaleiro de bronze nem consegue acertar seus meteoros no Cavaleiro fantasma. Entretanto Ikki chega em auxílio a Seiya.
O Cavaleiro de Fênix dá um poderoso golpe aéreo no inimigo. Mas logo em seguida Ikki é atingido bem na cabeça e Jaga no estômago. Ikki dispara seu Ave Fênix em meio a um furacão de fogo, mas surpreendentemente, o Cavaleiro de Orion retruca com o Choque Megatómico de Meteoros, utilizando a energia do golpe de Fênix. Arremessando-o contra a parede. Ikki fica desacordado. Neste momento Seiya se levanta, mas é espancado por Jaga. Nem Saori agüenta ver o massacre de seu protegido. Despertado pelo cosmo de seus amigos, Seiya se levanta revoltado e queima seu cosmo ao extremo alcançando o sétimo sentido. Misteriosamente surge a Armadura sagrada de Sagitário, envolvendo Seiya.
A Deusa da discórdia conta seus planos de domínio da Terra e a imposição de seu império de Cavaleiros Fantasmas. Pegasus parte para cima de Éris, mas é impedido por Jaga. O Cavaleiro de Orion ataca Seiya mais uma vez, agora com seu Choque Megatómico de Meteoros, que é repelido pela Armadura de Sagitário. Na seqüência, Seiya derrota Jaga com a poderosa Mega Centelha de Pegasus. Éris continua a despertar cadáveres que levantam de seus caixões. Assim sendo, Seiya saca o arco e a flecha de Sagitário e dispara a flecha de ouro que atravessa a cabeça de Éris e acerta a maçã sem atingir Athena. O Santuário do mau vem abaixo. Seiya consegue salvar Fênix, mas não Saori. Então surgem dos escombros: Saori, Shun, Shiryu e Hyoga carregando Eiri em seus braços.
Mais uma vez os santos guerreiros de Athena livram o mundo do mal que o
ameaçava.
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