Nosso herói começa sua jornada morrendo... Espere aí... Morrendo?! Isso mesmo, Yusuke morre ao salvar um menino que ia ser atropelado. Logo após, aparece Botan, uma espécie de Guia Sobrenatural do Mundo Espiritual, encarregada de buscar o espírito de Yusuke e levá-lo até Koenma, o "BigBoss" do Mundo Espiritual. Yusuke acaba passando por uma série de provações e é ressucitado por Koenma, que lhe impõe o cargo de Detetive Sobrenatural como condição. Yusuke sem muitas alternativas aceita o cargo e logo aprende a usar seus novos poderes.
Como primeira missão como Detetive, Yusuke foi encarregado de recuperar três tesouros sagrados, roubados do Mundo Espiritual. Nessa parte da trama que Yusuke acaba conhecendo Kurama e Hiei, dois dos ladrões procurados por ele. Koenma acaba recrutando Kurama e Hiei como ajudantes do Yusuke, como parte da pena por seus crimes. A partir daí sucedem-se várias missões, tendo também como ajudante seu antigo inimigo de escola, Kazuma Kuwabara.
Algum tempo depois, Yusuke e Kuwabara têm que resgatar uma garota, Yukina, que está prisioneira de um homem ganancioso pois suas lágrimas se transformam em pedras preciosas. Yukina é irmã de Hiei. Yusuke e Kuwabara acabam por conhecer os Irmãos Toguro, o mais forte inimigo com quem Yusuke já lutou até agora. Kuwabara e Yusuke saem dessa luta vitoriosos, mas os Irmãos Toguro não estão mortos...
A turma acaba sendo convidada (na verdade eles foram intimados...) para participar do Torneio das Trevas, do qual participam os monstros mais fortes do Mundo das Trevas. A mestra de Yusuke, Genkai, também participa do torneio (um grande reforço aliás...), mas disfarçada, com uma espécie de turbante ocultando seu rosto. Ocorrem duras batalhas até que a turma chega (por incrível que pareça, viva) nas finais do torneio contra o Time Toguro. Neste intervalo Mestra Genkai passa todo seu conhecimento para Yusuke, prevendo sua morte. Yusuke sofre muito ao receber a energia de Genkai, mas sua vontade de viver é maior e ele acaba vencendo o desafio. Genkai dirige-se ao encontro selado com Toguro, num local não muito distante de onde Yusuke estava. Mesmo com todo seu esforço, Genkai ficou muito fraca ao passar seu poder para Yusuke e acaba morrendo nas mãos de Toguro. Yusuke chega a cena e depara com o corpo de sua mestra, dilacerada, ainda viva, mas agonizando. Como último desejo, Genkai implora para que Yusuke não siga o caminho do mal como Toguro fez, tornando-se cada vez mais forte, e é claro, derrotando Toguro. Como Yusuke ainda não possuía total domínio sobre seus novos poderes, também é derrotado por Toguro, mas poupado para a luta final. Chega o grande dia, as finais do Torneio das Trevas.
A primeira luta é de Kurama contra Karazu. Kurama passa muita dificuldade até encontrar o ponto fraco de seu inimigo mas acaba por eliminar seu adversário. Na segunda luta, Hiei, sem menos sofrimento e num confronto maravilhoso, acaba por destruir Bui com seu Dragão Negro. Na terceira luta, Kuwabara sofre muito, mas consegue vencer o irmão mais novo de Toguro. Claro, o último duelo não poderia ser outro do que Yusuke Vs. Toguro. Toguro domina a luta totalmente pois Yusuke ainda não domina bem os poderes adquiridos dias atrás. Kuwabara acaba por se oferecer em sacrifício a Toguro, para provocar toda ira de Yusuke. O resultado não poderia ser outro, Yusuke, ao ver seu amigo morto (não bem morto...), é tomado por toda sua raiva e fúria, fazendo com que seu poder se eleve ao máximo. Yusuke desfere seu último e mais potente golpe, obrigando Toguro a se defender. Seu ataque foi tão intenso que Toguro mal conseguiu conter tanta energia, deu mais alguns passos, lançou alguns elogios a Yusuke e caiu morto no chão. O time de Yusuke é o vencedor. O estádio começa a desmoronar, todos os espectadores a fugir... A turma de Yusuke se une e sai do estádio, com todos vivos, até mesmo a grande Mestra Genkai, que é revivida por uma regra do Torneio das Trevas (o vencedor teria seu maior desejo atendido).
Pois é, parece que a tranqüilidade da nossa turma não dura muito tempo... Logo após o término do Torneio das Trevas surge um novo (e poderoso!) inimigo, Sensui, que enlouqueceu devido à maldade dos homens, está abrindo um buraco entre o Mundo dos Humanos e o Mundo das Trevas, buraco este que se for aberto completamente, resultará na total destruição dos seres humanos. Ao contrário de todos outros inimigos Sensui é um humano, muito poderoso, que a algum tempo atrás, também era um Detetive Espiritual. Juntamente com ele seis guerreiros extremamente fortes, também humanos, Sensui está atrás de alguém, com um poder muitos especial, que seja capaz de quebrar a barreira que divide o Mundo dos Homens do Mundo das Trevas. Essa barreira tem como objetivo prender os Monstros da categoria "S" no Mundos das Trevas ("S" de Super-Monstros, considerados os monstros mais poderosos).
Sensui acaba descobrindo que Kuwabara possui esse poder e acaba capturando-o. Logo a turma toda se mobiliza e vai ao resgate de Kuwabara, inclusive Hiei, um pouco contra sua própria vontade. Sensui encontra-se numa caverna, onde vem sendo aberto o túnel de ligação entre os dois mundos. Lá, a turma se depara com um dos seus inimigos, o garotinho Amanuma, o "Game Master", cujo poder consiste em tornar jogos em realidade.
Após terem derrotado Amanuma, a turma dirige-se ao encontro de Sensui, onde descobrem que o irmão mais novo de Toguro não havia morrido... E nem iria morrer, ele é imortal! Kuwabara logo se propõe a lutar de novo com ele, mas Kurama toma a frente. A batalha é difícil, Kurama vai levando a pior. Num golpe de mestre, Kurama prende seu inimigo numa planta com o poder de causar ilusões até que sua presa morra. Como o irmão de Toguro é imortal, ele fica preso na planta, eternamente. Chega a hora da batalha final.
Fica claro que o real objetivo de Sensui não era a construção do Túnel entre os dois mundos, mas sim, ter uma luta com um inimigo realmente poderoso, no caso, Yusuke. Nesse instante, Itsuke, braço direito de Sensui, captura o resto da turma e os prende numa espécie de outra dimensão, ficando apenas como espectadores da luta entre Sensui e Yusuke. Nosso herói leva o maior laço de sua vida! Koenma chega a cena determinado a derrotar Sensui. Koenma libera toda energia acumulada em sua chupeta durante centenas de anos mas nem isso é capaz de deter Sensui. Totalmente desanimado Koenma cai, ao mesmo tempo que Yusuke levanta, determinado a vencer dessa vez.
Nada muda, Sensui continua levando uma grande vantagem. Vendo seu amigo a caminho da morte, Kuwabara junta toda sua energia e consegue romper a dimensão gerada por Itsuke, porém, tarde de mais. Sensui perfura o peito de Yusuke, que cai morto no chão. Após alguns momentos de tristeza, a turma vai para cima de Sensui, que foge através do Túnel de ligação entre os mundos. Chegando a barreira, Sensui provoca Kuwabara, que com certa facilidade, rompe a divisória entre os dois mundos com seu poder .
A luta tem continuidade no Mundo das Trevas, ainda com Sensui levando extrema vantagem. Nesse instante, é revelado que Yusuke não está morto e que em suas veias correm sangue de demônio. Com forças renovadas, Yusuke levanta-se e vai atrás de seus amigos. Chegando lá, Yusuke interrompe a luta para espanto de Sensui. Espanto não tão grande quanto a nova força de Yusuke.
A luta recomeça, agora, muito mais equilibrada, até mesmo com momentos de vantagem para Yusuke. Num momento crítico da batalha, o Demônio "Pai" acaba dominando Yusuke e lhe mostrando seu real poder. Yusuke, agora em sua forma demoníaca domina totalmente a luta e destrói Sensui... Chega ao fim mais uma dolorosa batalha, mas não a última...
Logo após derrotar Sensui, Yusuke visita uma antiga Detetive Espiritual para se aconselhar. Cada um vai seguindo seu rumo. Durante essa visita, Yusuke é interrompido por três monstros do Mundo das Trevas, dizendo terem sido mandados por Leizen, o pai demônio de Yusuke. Os monstros informam que Leizen está a beira da morte e o quanto deseja conhecer Yusuke. Também lhe é informado que Leizen está em guerra com outros dois poderosos monstros, Mukuro e Yomi, a mais de 500 anos.
Yusuke atende ao chamado e vai ao encontro de seu pai no Mundo das Trevas. Kurama é convidado por Yomi, um antigo companheiro de roubos e Hiei é convidado por Mukuro. A princípio, Yusuke só deseja tomar satisfações pois Leizen havia intrometido-se em sua luta com Sensui mas pouco depois começa a treinar arduamente. Hiei é trancafiado num subterrâneo e atacado em massa por monstros classe "A" como parte de um treino imposto por Mukuro. Kurama lembra-se dos velhos tempos e conhece o reino de Yomi. Chega o dia da morte de Leizen.
Logo depois Yusuke propõe um torneio do qual participariam todos aqueles que tivessem interesse em governar o Mundo das Trevas. As equipes vão se formando, inclusive com alguns conhecidos do Torneio das Trevas. As batalha vão se passando. Kurama luta com Shigure e o vence. Hiei luta contra Mukuro mas seu Dragão Negro acaba sendo derrotado pela força e experiência de Mukuro, que acaba sendo derrotado na semifinal. Yusuke tem uma árdua batalha com Yomi, na qual após lutar bravamente, acaba sendo derrotado. A luta final se dá entre Yomi e Enki, um antigo companheiro de luta de Leizen. Como Yomi gastou muita energia para vencer Urameshi , acaba sendo derrotado por Enki na grande final, que se torna o novo governante do Mundo das Trevas.
Kurama resolve ficar no Mundo dos Homens trabalhando na empresa de seu
padrasto e entra em contato com Kuwabara, que já estava sentindo
falta de seu rival preferido, Yusuke. Hiei prefere permanecer no Mundo
das Trevas e trabalhar no exército de Mukuro. Toda turma reúne-se
na mansão de Genkai, preocupados com a demora de Yusuke. Keiko,
desesperada (e muito mais gatinha...) grita por seu amado Yusuke, que,
como num conto, aparece em suas costas, com a mesma cara de safado de sempre.
Tudo volta a sua ordem e paz rotineira, com Yusuke e Keiko juntos.
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