2.01 - Skins and Bones

Quando Nasedo acaba com a unidade especial do FBI se passando por Pierce, um geólogo descobre acidentalmente os ossos do verdadeiro Pierce enterrado no deserto. A descoberta acaba fazendo com que a investigação de aliens recomeçasse, justo quando Max, Isabel, Tess, e Michael pensavam que a ameaça do governo havia terminado finalmente.

2.02 - Ask Not

Um alienígena assassino está solto em Roswell, e Milton vende o Centro de OVNI inesperadamente a um estranho misterioso. Max começa a comparar a situação dele e algo que está estudando na aula de história. E Tess irá morar com os Valenti.

2.03 - Surprise

É o aniversário de Isabel. mas ela ganhará mais do que imagina quando decobrir que alguém seqüestrou Tess e ela pode estar morta. E Isabel descobre um segredo surpreendente sobre o próprio passado.

2.04 - Summer of 47

Quando Michael entrevista um velho soldado militar para um projeto da escola, o soldado revela segredos sobre a queda de 1947 e conta o que aconteceu naquela época para Michael. As autópsias em extraterrestres e tudo que os militares esconderam sobre o assunto é a chave do seu passado, presente e futuro. Nós veremos tudo através da visão de Michael, que será o jovem soldado.

2.05 - The End of the World

Max viaja no tempo para o presente para dizer a Liz que seu relacionamento irá ameaçar o futuro de seu planeta, pois Tess terá se virado má, tendo matado Michael e Isabel. Então eles fazem um plano para mudar o futuro, quando Liz arma para que Max acredite que ela transou com Kyle, traindo o Max do presente de uma maneira que ele nunca esquecerá.

2.06 - Harvest

Max e a gangue decidem investigar a cidade natal da Congressista Whitaker no Arizona quando ficam sabendo da sua suspeita morte. Quando chegam, descobrem que a cidade será o centro da indústria de "Skins".Enquanto isso, Isabel se encontra com os 'harvested skins' em um porão da sociedade secreta.

2.07 - Wipe Out

Depois de fazer com que todos os humanos desaparecessem e transformar Roswell numa cidade fantasma, os Skins capturam e torturam Max, Isabel, Michael e Tess para descobrir a localização do Granlith, resultando na morte de um dos aliens.

2.08 - Meet the Dupes

Max, Isabel, Michael e Tess encontram suas cópias. Versões duplicadas de Isabel, Michael e Tess chegam em Roswell para tentar convencer Max a voltar para Nova York com eles para uma missão interestelar que poderia levá-los para seu planeta natal.

2.09-Max in The City

Sentindo-se traído por Isabel, Max deixa Roswell e vai para a Missão interstellar em Nova York com as versões duplicadas de Michael e Isabel, que têm uma agenda diferente para o futuro rei.

2.10 - A Roswell Christmas Carol
Enquanto Roswell está infestada com o espírito do Natal, Max se sente culpado após presenciar uma tragédia e não usar seus poderes para salvar um homem que sacrifica sua própria vida para salvar sua filha. O fantasma assombra Max e o confronta sobre sua decisão, questionando seus poderes de cura poderes e a inclinação para brincar de Deus

2.11 - To Serve and Protect
Um oficial vai a Roswell investigar a morte de Everett Hubble, e o Xerife Valenti se sente ameaçado. Enquanto isso, Isabel é atormentada por visões de uma jovem mulher que foi enterrada viva em algum lugar no deserto, mas após salvá-la ela fica com ciúmes quando a vê interessada em Alex

2.12 - We Are Family
Sheriff Valenti é suspenso após se recusar a responder as perguntas do FBI sobre Max e Isabel. Mas Laurie Dupree escapa da instituição mental e aparece em sua casa alegando estar sendo perseguida por extraterrestres, e pedindo sua ajuda como delegado. Enquanto isso, Alex volta de sua viagem a Suécia com uma nova perspectiva e Valenti descobre a verdade sobre Kyle

2.13 - Disturbing Behavior
Enquanto Michael e Maria fogem de Roswell após ajudar Laurie DuPree a escapar da polícia, Max descobre que um parasita mortal foi liberado no ecossistema da Terra quando o seu navio bateu há 50 anos atrás e contata um aliado de outro mundo para ajudá-lo.

2.14 - How the Other Half Lives
Max tenta salvar Alex e Kyle de serem enterrados vivos, enquanto Isabel é seqüestrada e Michael leva um tiro quando tenta proteger Laurie de uma tropa de aliens.

2.15 - Viva Las Vegas
Os nervos de Michael estão a flor da pele, e então ele decide que Max e ele deveriam viajar para Las Vegas para se distraírem. Isabel e Maria descobrem o plano dos garotos e se convidam para ir junto. Então, Tess, Kyle, Liz e Alex sabem da notícia e se juntam ao grupo.

2.16 - Heart of Mine
O baile do colégio se torna um transtorno emocional quando Liz atenta o destino pedindo que Max seja seu par, Isabel decide que Alex é o homem que está procurando, enquanto Michael diz a Maria que não irá levá-la ao baile. Ela suspeita então que Michael esteja envolvido com outra pessoa, e secretamente investiga com Liz. E Kyle chega a uma conclusão sobre Tess

2.17 - Cry Your Name
Depois de Alex morrer misteriosamente em um acidente de carro, a turma procura por respostas. Enquanto eles se preparam para o funeral e o memorial na escola, Isabel conta que está deixando a cidade para ir para faculdade. E, Jerry, o entregador, dá a Liz um recibo assinado por Alex em código binário, que pode ser a chave para o mistério de seu falecimento.

2.18 - It's Too Late & It's Too Bad

Liz continua sua investigação sobre a morte de Alex e pede a ajuda de Sean para arrombar o escritório do conselheiro de orientação escolar, onde ela faz uma fotocópia do arquivo pessoal de Alex e chega a uma conclusão surpreendente. Enquanto isso, Isabel fala para Max que recebeu uma carta de uma faculdade e que deixará Roswell em breve. E Maria termina o namoro com Michael porque ela não aguentaria vê-lo partir para outro planeta.

2.19 - Baby, It's You

Liz convence Maria a ir com ela para Universidade de Las Cruces, onde elas descobrem que Alex estava no laboratório de linguística sob o nome de Ray Bradbury, quando ele deveria estar na Suécia. Então elas chamam o Michael para ajudá-las. No quarto de Alex, eles descobrem que ele escreveu coisas sobre Leanna, uma skin contratada por Nicholas para vigiá-lo, e que ela estaria em uma reunião da Amizade Universal durante um show. Enquanto isso, quando Tess sofre com os sintomas da gravidez Max acaba descobrindo que o bebê está sufocando com a atmosfera terrestre e que sua única salvação é voltar para o planeta natal. E Kyle e Isabel brincam com o novo poder de Kyle.

2.20 - Off The Menu

Quando Brody se lembra da sua abdução e de que era Larek, suas memórias e as do alien se misturam o levando a loucura, e afim de obter respostas ele mantém Max, Tess e Maria como reféns no UFO Center. Na tentativa de salvar a todos e 'curar' Brody, Max inadvertidamente vê sua vida passada e seu amor por Tess. E Liz e Max descobrem que há algo estranho na comida do Crashdown.

 2.21 - The Departure

Os aliens têm que voltar para o planeta natal ou o bebê de Tess morrerá. Então eles vão dizer adeus aos amigos e parentes e Max ainda quer descobrir o assassino de Alex. Max e Liz vão atrás de Leanna e descobrem que ela é humana. Enquanto isso, Michael se despede de Maria preparando um jantar e diz que ela nunca teve flashes dele como a Liz teve de Max porque ele não queria que ela o 'visse'. Então ela finalmente tem flashes dele, quando eles transam. Kyle tem visões de Alex e Tess. E Liz acaba descobrindo que Tess tem entrado na cabeça das pessoas. Então Kyle e Liz descobrem que Tess entrou na cabeça de Alex para que ele traduzisse o livro para ela e acidentalmente o matou. Enquanto isso, os quatro aliens estão no Granilith se preparando para irem embora quando Michael desiste de ir e prefere ficar com Maria. Max e Isabel se despedem dele e quando Michael sai da câmara encontra Liz, Maria e Kyle no rochedo. Eles contam toda a verdade sobre Tess, o que acabará levando a Max e Isabel a desistirem de ir e Tess é a única que volta para o planeta natal.