Reino PROTOCTISTAS
Subreino Ficofitos o Ficobiontes
División
Euglenofitas
Clase Euglenofíceas
División Criptofitas
Clase Criptofíceas o Criptomonadáceas
División Dinofitas
o Dinoflageladas
Clase Dinofíceas o Pirrofíceas
División Haptofitas
Clase Haptofíceas
División Clorofitas
Clase Clorofíceas
Clase Zignematofíceas
Clase Prasinofíceas
Clase Carofíceas
División Crisofitas
o Heterocontofitas
Clase Cloromonadofíceas o Rafidofíceas
Clase Xantofíceas o Tribofíceas (+Eustigmatofíceas)
Clase Crisofíceas
Clase Bacilariofíceas o Diatomeas
Clase Feofíceas
División Rodofitas
Clase Rodofíceas
Subreino Mastigobiontes o Mastigomicotas
División Quitridiomicotas
Clase Quitridiomicetes
División Oomicotas
Clase Oomicetes
Clase Hifoquitridiomicetes
Subreino Mixobiontes o Mixofitos
División Acrasiomicotas
Clase Acrasiomicetes
División Mixomicotas
Clase Mixomicetes
Clase Protosteliomicetes
División Plasmodioforomicotas
Clase Plasmodioforomicetes
División Labirintulomicotas
Clase Labirintulomicetes
Subreino Protozoos
División Mastigóforos
o Flagelados
Clase Fitomastigóforos (> Ficofitos)
Clase Zoomastigóforos
Clase Opalinas
División Sarcodinos
Clase Rizópodos
Clase Actinópodos
División Apicomplejos
o Esporozoos
Clase Perkínseos
Clase Telospóreos
Clase Piroplásmeos
Clase Toxoplásmeos
Clase Haplospóreos
División Cnidosporas
o Mixozoos
Clase Mixosporídeos
Clase Microsporídeos
División Cilióforos
o Ciliados
Clase Kinetofragminóforos
Clase Oligohimenóforos
Clase Polihimenóforos