教皇的刺客
回到大宅後，沙織亦從已故的爺爺–城戶光政的遺言中，得悉自己就是女神雅典娜的化身！這時候杜古拉斯突然出現，並把沙織
拐走。由於沙織被杜古拉斯捉去，所以星矢等人便帶同黃金聖衣的頭罩，到鬥技場交換人質，最後星矢等人合力擊敗了杜古拉斯！
繼杜古拉斯的失敗後，教星亞歷士命令幽靈聖鬥士去奪回頭罩。幽靈聖鬥士首領–艾絲特利用幻影把頭罩騙到手。幸好，利用城戶財團的人造衛星發現到幽靈聖鬥士的所在地–魔界島，於是星矢
等人便馬上出發往魔界島！最後，終於到了星矢和艾絲特的對決，在黃金聖衣的幫助下，終於擊敗艾絲特，重奪頭罩。
為了安全問題，沙織和瞬遷離了城戶邸。而星矢等人亦為了耍知道聖域發生甚麼事而各自回到師傅身邊，當星矢回到希臘後，他便立即受到撒娜的攻擊。在這時，魔鈴突然出現，她告訴星矢，冰
河現在處境十分危險，因教皇已把冰河的師傅–水晶聖鬥士洗腦。
所以要星矢馬上去救冰河……
冰河回到西伯利亞亦發覺事情不妙，已往仁慈的師傅，竟然把村民全逼去建造冰金字塔。冰河為了拯救村民，於是一場師徒之戰便展開……當星矢到達時，他們已打得難分難解，最後水晶聖鬥士
終於清醒了，可惜還是死在冰河的面前。
另一方面，教皇派出炎熱聖鬥士追殺沙織及瞬。在炎熱聖鬥士的猛烈攻擊下，瞬漸漸支持不住，正在危急間，不死鳥一輝突然出現，「鳳凰幻魔拳」一出，炎熱聖鬥士倒下了，兄弟又再重逢！同時星矢、冰河與紫龍亦從各地回來，五名正義戰士又再聚首一堂。
當一輝與大家回到沙織那兒，教皇的攻擊好像暫時停止了，星矢藉此機會和美穗到海邊遊玩，但他們竟踫上白銀聖鬥士天鷹座–魔鈴，原來她這次是受了教皇之命，和白銀聖鬥士蜥蜴座–美斯狄一同來殲滅那些反叛的青銅聖鬥士。幸好，貴鬼利用超能力，替星矢帶來天馬聖衣，於是青銅與白銀的大戰開始！
因為星矢和美斯狄的實力相差太遠，魔鈴使出空拳，想瞞騙美斯狄，希望能讓星矢逃脫。但他並沒有中計，無法避免的戰鬥，星矢的流星拳對美斯狄完全起不了作用，在一場惡戰後，星矢終於利用捨身戰法，用「天馬慧星拳」和「天馬迴旋碎擊拳」，把美斯狄擊敗。另一方面，魔鈴因救星矢，而被白銀聖鬥士白鯨座–摩西斯和獵犬座–艾里奧攻擊……星矢為救魔鈴，不得不和他們作戰，並且因知道了魔鈴可能就是自己的姐姐，因而引發小宇宙，將摩西斯打敗！
當魔鈴擊敗艾里奧後，星矢由於力盡而倒下，醒來時已不見了魔鈴，只留下「保護雅典娜」的字句……從辰己口中得知沙織就是雅典娜女神的化身！突然，又有一名聖域派來的刺客出現，是白銀聖鬥士半人馬座–巴別。可是這時只得冰河一人能應戰，在巴別的猛烈火燄攻擊之下，冰河漸漸不敵，非常危險。忽然，有三名自稱鋼鐵聖鬥土的神秘戰友相助，令形勢扭轉……
受到白銀聖鬥士巴別攻擊的冰河，由於得到三名神秘的鋼鐵聖鬥士幫助，所以反敗為勝。而且，沙織亦發揮她的小宇宙，讓巴別脫離邪惡而含笑而逝……為了要偵察敵
情，星矢、瞬和紫龍便乘專機前往希臘，但途中飛機受到一股強大念力所影響，被逼降於地中海一小島上……原來教皇設下陷阱，派出聖域中最強念動力者–史巴達及白銀聖鬥士撒娜和英仙座–亞魯高來伏擊他們，對於這突如其來的襲擊，星矢只好先把撒娜打敗。但跟他和瞬都一起被亞魯高的美杜莎之盾化為石像，只得紫龍可利用天龍盾而幸免於難。而紫龍雖是孤軍作戰，但他利用戰術，使亞魯高誤將史巴達變成石像，於是一對一的決戰開始了！
有美杜莎之盾保護的亞魯高，令紫龍的「廬出昇龍霸」完全不能發揮威力，連後來趕到的鋼鐵聖鬥士也一一敗陣下來。在這時，紫龍只好使出最後手段，把自己雙目弄毀！在這捨身的行動中，美杜莎之盾對紫龍已失效。再藉着雅典娜女神的指引，紫龍再次使出「廬出昇龍霸」，
終於把亞魯高打倒了！
已失明的紫龍，與春麗回到五老峰休養。而一輝則離開沙織等人。沙織亦和星矢等人返回曰本，但她開始擔心自己能否應付雅典娜女神化身的責任。正當此時，白銀聖鬥士烏鴉座–積安和他的烏鴉軍團出現，把沙織擄去了。星矢把小宇宙發揮至極限對付積安，為了要救回沙織，星矢還身受重傷！
為了拯救沙織，星矢受了傷，而追兵撒娜和積安亦趕到，星矢在沒有選擇下唯有和沙織一同躍下斷崖，在崖下沙織看為了她而身受重創的星矢，決心不再令大家失望，重新振作起來……可是追兵又再出現，但今次沙織發揮她巨大的小宇宙，把二人鉗制，剛好，冰河和瞬二人趕到，把撒娜擊退。但新的敵人又來了……
白銀聖鬥士御夫座–伍居兒和地獄犬座–鄧地出現，這次輪到冰河和瞬陷於困境，最後他們更被打落斷崖下，幸好鉤壁面的樹才救回一命。正當白銀聖鬥士想向沙織下毒手時，一輝又再次土現，並劃下生死線來威嚇白銀聖鬥士，並憑着一招「鳳凰幻魔拳」將伍居兒打倒，再一招「鳳翼天翔」，令鄧地元氣大傷。之後一輝便交由瞬和冰河收拾殘局，自己則悄然離去。
離開了星矢等人的一輝，原來是返回皇后島接受黑暗聖鬥士的新首領–積高的挑戰。積高派出黑暗鳳凰用「黑暗凰凰幻魔拳」對付一輝，幸好一輝憑對艾斯美達的信念及趕來救他的星矢等人，終於把積高及其手下消滅了。但島上的火山突然爆發，原來這又是教皇的陷阱。幸好沙織發放她的小宇宙，救了星矢等人。
回到中國後的紫龍，雖有春麗悉心照顧，但發覺自己己是廢人而煩惱。某日，紫龍和春麗到河邊游泳，春麗遇溺但紫龍因雙目失明而無法救她，幸好，他的師兄王虎及時救了春麗，但他今次來的目的是要和紫龍決一生死的！當年王虎由於生性凶殘，於是被逐出師門，但他不停練功，決心要回來報仇……
失明的紫龍，還失去了自信，所以被王虎輕易打敗了﹗幸好，紫龍得到老師的啟示，終於醒悟了，再和王虎正式決鬥……終於紫龍的小宇宙爆發，再度使出「廬山昇龍霸」將王虎打敗。另一方面，星矢為了醫好紫龍的雙眼。於是去找穆先生……突然，聖域中的人馬座黃金聖衣的八件部件和沙織的黃金聖衣頭罩，都同時失蹤，並在某處地方聚合在一起！
對於黃金聖衣的失蹤，沙織用盡城戶財團的力量去找回……另一方面，星矢從貴鬼口中得知在靈峰中的生命之水是能治百病。於是星矢便開始艱苦旅程……最後更擊敗聖域派來的刺客–狼蛛艾勒尼，取得生命之水。可惜，這藥對紫龍並不起作用。而在聖域方面，教皇看到白銀聖鬥士不是星矢的對手，終於決定出動他的皇牌–黃金聖鬥士。
終於取得生命之水的星矢，馬上托貴鬼把生命之水送到五老峰去，之後星矢因疲勞過度而倒下……另一方面，教皇亞歷士派出獅子座黃金聖鬥士–艾奧里亞出戰，因他要洗去哥哥–艾奧羅斯所帶給他的污名……就在星矢臥病在床的時候，一次又一次要殺死星矢的撒娜又再出現……
正當星矢和撒娜互相對峙時，聖域來的殺手–艾奧里亞終於出現。就在星矢不敵之時，撒娜竟為星矢擋去艾奧里亞的一拳……而教皇派來監視的三名白銀聖鬥士銀蠅座–狄奧、巨犬座–史里烏和武仙座–亞路傑狄，亦開始行動，務求將星矢置於死地。怎料人馬座黃金聖衣突然出現，並自動裝着到星矢的身上！
有了人馬座黃金聖衣的星矢，很輕易便擊敗了三名白銀聖鬥士，只剩下艾奧里亞。可是，星矢始終未能將黃金聖衣的威力完全發揮，因此形勢越見不利。及後沙織以女神之身份出現，將艾奧羅斯的正義捨身一一說明，加上艾奧羅斯的靈魂又出手幫助星矢，這一切終使艾奧里亞軟化，之後便返口聖域了。
失明的紫龍，雖得到生命之水，但並無治好雙眼。突然，巨蟹座黃金聖鬥士–迪斯馬斯古奉教皇之命闖進五老峰，刺殺被冠上叛賊之名的童虎。紫龍為救師傅，而與迪斯馬斯古在大瀑布大戰一場。正當紫龍處下風之際，白羊座黃金聖鬥士–穆突然出現制止，迪斯馬斯古祇好知難而退。
沙織和星矢等決定返回聖域。臨行前，各人返回舊地星子學園話別，星矢返回星子學園與美穗話別，星矢答應美穗必定完成任務後回日本。前往聖域當日，瞬遇見共同
修業的青銅聖鬥士蝘蜓座–珍妮，得知其師被天蠍座黃金聖鬥士殺了。但是，憎恨瞬的師兄弟–利達和史碧加突
然出現！
利達和史碧加的鎖鏈攻擊令瞬陷於苦戰之中。當瞬處於危機之際，得到一輝的小宇宙鼓勵，擊敗被教皇所控制的師兄弟。
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