Primitivamente a localidade de Navegantes, assim como toda a Itajaí, era habitada por índios carijós. Em 1795, José Ferreira de Mendonça, piloto demarcador da Real Fazenda, veio, por ordem do Conde de Resende, Vice-Rei do Estado, demarcar uma sesmaria na praia de Itajaí.
A Comunidade de Navegantes, canonicamente, pertencia à Paróquia do Santíssimo Sacramento de Itajaí . Atendendo a uma solicitação do Pe. Antonio Eising, Vigário Interino da Paróquia de Itajaí, a "Camara Episcopal de Corytiba" concedia, a 23 de janeiro de 1896, "licença para que no lado esquerdo do Rio grande de Itajahy se possa erigir uma capela sob a invocação de Nª Sª dos Navegantes, de S. Sebastião e de S. Amaro". A referida Capela ficou pronta em 1907 sendo sua inauguração comemorada com três dias de festas: 7, 8 e 9 de setembro. |
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Até o ano de 1912, Navegantes, um bairro de Itajaí, não tinha denominação, era conhecido apenas como "outro lado". A partir daí começou-se a discutir a necessidade de dar-lhe um nome. Diversas sugestões apareceram, até que, em 17 de dezembro de 1912, o Conselho Municipal deu-lhe o nome de Navegantes, tendo em vista o arraial ser habitado, em sua maioria, por navegadores e já ter como Padroeira Nossa Senhora dos Navegantes.
Em 1961, ao assumir a Prefeitura Municipal de Itajaí o Sr. Eduardo Solon Cabral Canziani, pela Lei nº 369, de 28 de fevereiro, desapropria uma área de terras, em Navegantes, para nela ser construído o novo aeroporto da Cidade, que hoje lá está, atendendo a todo o Vale do Itajaí.
Em 2 de fevereiro de 1962, por Decreto da Cúria Metropolitana, assinado por Dom Joaquim Domingues de Oliveira, era criada a Paróquia de Nossa Senhora dos Navegantes. Seu primeiro Vigário, Pe. Gilberto Luís Gonzaga, foi nomeado por Provisão de 8 de maio, sendo que a solene instalação da Paróquia e posse do primeiro Pároco aconteceram somente a 26 de agosto daquele ano.
Em 14 de maio de 1962, a Resolução nº 2 da Câmara Municipal de Itajaí autoriza o desmembramento da localidade de Navegantes. A Lei Estadual Nº 828, de 30 de maio de 1962, eleva Navegantes à categoria de Município.
Em 1987, a 19 de julho, fazendo parte dos festejos comemorativos dos 25 anos de criação da Paróquia, em cerimônia coordenada pelo então Pároco, Pe. Hélio da Cunha, presidida por Dom Murilo Sebastião Ramos Krieger, Bispo Auxiliar da Arquidiocese de Florianópolis, do Pároco, e concelebrada por diversos Sacerdotes, foi, solenemente, feita a dedicação do Altar e da Igreja Matriz.
Anualmente, a 2 de fevereiro, celebra-se a festa da Padroeira, Nossa Senhora dos Navegantes, com uma grandiosa procissão fluvial, para a qual afluem fiéis desta e de Paróquias vizinhas.
Um Decreto da Cúria Metropolitana de Florianópolis, datado de 23 de julho de 1996, com vigência a partir de 18 de agosto de 1996, cria na igreja matriz de Nossa Senhora dos Navegantes o Santuário Arquidioceseano sob a invocação de Santuário de Nossa Senhora dos Navegantes. A solene instalação e possse do primeiro Reitor deu-se às 18 horas do dia 18 de agosto do mesmo ano, sendo presidida pelo Sr. Arcebispo Metropolitano.