淨化水晶的方法：

1. 日光照射法 → 把水晶放置於陽光下照射約半小時至一小時。(此方法絕不適用於紫、紅水晶，因內含Fe(鐵)或Cu(銅)元素，長時間暴曬會導致氧化而退色。)

2. 粗鹽埋淨化法 → 把水晶埋進盛滿粗鹽的容器內，此法不單能淨化水晶，亦可收補水晶內的石紋，若用以色列死海的鹽則效果更好。(容器要用蓋封好，避免鹽受潮。帶金、銀的水晶飾物不可用此法。)

3. 晶簇清洗法 → 把水晶放在天然的白水晶簇上，或紫水晶洞內最少廿四小時，會有不錯的淨化效果。(晶簇越優質，效果越好。)

4. 水淨化 → 把水晶放在過濾後的自來水下沖十五分鐘，或把水晶放在蒸溜水內一小時或以上。 (但比較浪費水‧‧‧)

5. 低溫淨化法 → 把水晶放於雪櫃內一晚，可達淨化效果。(但水晶的膨脹力極低，熱漲冷縮的結果，水晶很容易便碎裂。)