日光照射法--
把水晶放置於陽光下曬數小時，但切記此方法不適用於紫、紅水晶，因內含Fe(鐵)或Cu銅元素，長時間暴曬會導致氧化而退色。
低溫淨化法--
放水晶於雪櫃內一晚(𣎴要放在冰格,冷縮熱縮會導致較大的水晶有出現裂痕的危險)，可達淨化效果。事前把水晶用保鮮袋封好，以免水晶吸收雪櫃內的異味。
香薰淨化法--
將水晶放於香薰爐旁，也可達到淨化效果，但效果較𣎴明顯。
鹽埋淨化法--
把水晶埋進盛滿鹽的容器內，此法𣎴單能淨化水晶，亦可收補水晶內的石紋，若用以色列死海的鹽則效果更好。但要用蓋封好，避免鹽受潮。帶金、銀的水晶飾物不可用此法。
念力淨化法--
靈修者用其意志力刪除水晶內的資料，但此方法只有長時間靈修的人才能做到。
溪水淨化法--
把水晶帶到沒有污染的溪流清洗，水晶可受大自然的正能量淨化。但一定要在溪流中用流動的溪水淨化，不可把溪水帶回家中清洗水晶，因為溪水離開溪流後已帶有負能量。
晶簇清洗法--
把水晶首飾放於天然水晶簇上或水晶洞內，會有不錯的淨化效果。