En el Atlético de Madrid se trabaja para el segundo proyecto Gil, ilusión que ha nacido en el crepúsculo del primero. Se incorporan al cuadro rojiblanco el goleador brasileño, Baltasar, formidable jugador procedente del Real Club Celta de Vigo; el cacereno Manolo que jugaba en el Real Murcia, el delantero centro Carlos, del Real Oviedo, Torrecilla, del Real Valladolid, Orejuela y Luis García, del Real Mallorca y Donato del Vasco da Gama. Todos a las ordenes del entrenador Maguregui inician la temporada disputando en Grecia, el Torneo Cuadrangular de Atenas. El 16 de agosto, en primera instancia ante el Olimpiacos, con triunfo helenico por dos (Funes y Kafidis), Atlético de Madrid uno (Manolo). En partido de consolación para el tercer puesto, los rojiblancos empatan a tres con el Penarol, goles marcados por Futre, Manolo y Baltasar y los uruguayos por Rodríguez, Ramos y Herrera. En Valladolid, el Atlético de Madrid disputa el Trofeo de la Amistad, el 21 de agosto de 1988, al Real Valladolid. El equipo pucelano se impone al rojiblanco madrileño por un gol a cero, marcado por Fonseca. El Atlético de Madrid en la disputa del Trofeo de la Amistad con el Murcia, los colchoneros vencen por tres a uno, al equipo de la Condomina. En el Trofeo Carranza, de Cádiz, el 27 de agosto, el Atlético de Madrid y el Penarol de Montevideo empatan a un gol. La tanda de penaltys favorece a los rojiblancos. El día 28, el Vasco da Gama vance por dos a uno al Atleti, en la final. El Trofeo Villa de Madrid, disputado a partido único, el 31 de agosto de 1988, entre el Atlético de Madrid y el Wender Bremen. Lo gana el equipo alemán por un gol a cero, marcado por Luis García en propia meta. La Liga de 1988-1989, comienza para el Atlético de Madrid bajo mínimos, no puntúa hasta la cuarta jornada. En Copa de la UEFA, el 7 de septiembre, el Atleti juega en Holanda contra el Groningen, pierde por un gol a cero, un partido que puede empatar. En Madrid, el 5 de octubre, a los tres minutos de juego Baltasar de penalty empata la eliminatoria. Los holandeses consiguen un gol, entonces afloran los nervios en el conjunto rojiblanco, Futre logra poner el marcador dos a uno, pero falta temple para sacar adelante la eliminatoria. ¡Pudo el nerviosismo! En los partidos de pretemporada y los de competiciones oficiales el juego de conjunto del equipo rojiblanco no corresponde a la calidad de sus individualidades. Carece de patrón de juego definido y de poderío futbolistico. Esto motiva el cese del entrenador José María Maguregui. Se encarga del equipo Antonio Briones, en las dos jornadas que esta de responsable, el Atlético logra cuatro puntos, ganando por 2 a 1 al Club Deportivo Málaga 6 a 1 al Real Club Deportivo Español. Tras este partido, comienza a entrenar al equipo rojiblanco el ingles Ron Atkison. En la decimocuarta jornada de Liga, 3 de diciembre de 1988, en el Estadio Bernabeu, se enfrentan Real Madrid y Atlético de Madrid. Partido bronco con escándalo arbitral del colegiado Martín Navarrete. El equipo merengue se mantiene con veintiún puntos en la clasificación, el Atleti con dieciséis puntos, sale decidido a dar el do de pecho, cortar distancias y demostrar que pugna por la cabeza de la clasificación. No es posible por las cosas raras que ocurren en el fútbol. El encuentro concluye con victoria madridista por dos goles a uno. Marca Julio Llorente, empata Manolo y Martín Vázquez en el ultimo minuto logra el segundo gol para el Real Madrid. El arbitro del escándalo expulsa a Tendillo, Futre y Orejuela, mientras mantiene en el terreno de juego a Buyo que ha organizado la mayoría del jaleo con un gesto antideportivo al hacer falta con agresión, en una salida fuera del área, a Orejuela y fingir lesión. Estos hechos levantan fuerte polémica, en los mentideros deportivos se habla de la extraña intimidación de los árbitros cuando pitan al Real Madrid. El Comité de Competición después de ver las imágenes del vídeo de televisión de lo sucedido entre Buyo y Orejuela, castiga con cuatro partidos de suspensión al guardameta madridista. Por fin se impuso la cordura. A mediados del mes de enero de 1989, el Atlético de Madrid no contento con el comportamiento del entrenador Atkison le cesa al termino del partido entre el equipo rojiblanco y el Real Club Celta, que termina con empate a cero. Ocupa el puesto del británico en el banquillo el ayudante de este, Addison. Este técnico ingles, tampoco consigue el deseado nivel competitivo para el equipo. Cuando faltan dos jornadas para terminar el Campeonato de Liga queda despedido, volviéndose a hacer cargo de la dirección técnica del Atleti Antonio Briones hasta final de temporada, que coge las riendas Javier Clemente. La Liga termina con el Real Madrid Campeón, con 62 puntos, F.C. Barcelona (57), Valencia C.F. (49), Atlético de Madrid (46), Real Zaragoza (43), Real Valladolid (43), Athletic de Bilbao (42), Real Club Celta (39), Sevilla C.F. (38), Osasuna (37), Real Sociedad (36), Real Oviedo (35), Sporting de Gijón (35), Logrones (34), Cádiz C.F. (33), Club Deportivo Málaga (33), Real Club Deportivo Español (30), Real Betis (29), Real Murcia (24) Elche (15). Baltasar queda máximo goleador de la Liga, "Pichichi", con treinta y cinco goles, con su proverbial potencia de tiro y maestría en el remate En Europa al brasileño rojiblanco le proclaman "Bota de Bronce". La Unión Deportiva Las Palmas y el Real Club Deportivo Español quedan eliminados de la Copa respectivamente por el Atlético de Madrid, que en cuartos de final se enfrentan al F.C. Barcelona. El 5 de abril de 1989, se registran un empate a tres en el Camp Nou. El día 12, en el Estadio del Manzanares, festival de goles rojiblancos, con cuatro a cero en el marcador. Arbitra Urio Velázquez y los equipos se alinean de la manera siguiente: por los azulgrana juegan Zubizarreta; Serna, Alexanco (Carrasco), Aloisio, Julio Alberto; Eusebio, Amor, Roberto, Sabater; Lineker yJulio Salinas. Por el Atlético de Madrid Abel; Tomas, Sergio, Goicoechea, Juan Carlos; Donato, Marina, Orejuela; Manolo, Baltasar y Futre (Carlos). En semifinales nuevo enfrentamiento entre los rivales madrileños, con errores arbitrales. En el Estadio del Manzanares, el Real Madrid sorprende al Atleti y gana por dos goles a cero. El partido de vuelta en el Estadio Bernabeu los rojiblancos salen por todas, Baltasar logra un gol lícito que el arbitro García de Loza invalida de manera injusta. Después la moviola televisiva deja ver el craso error. Quebrantada la proeza, maltratada la aventura copera, de nada sirve a los colchoneros su bravura y Fu destreza, terminan perdiendo por uno a cero y eliminados. Todo el afán y sueno del segundo proyecto Gil es ya ilusión oscurecida, perdida entre las sombras de una temporada sin la respuesta adecuada. El tercer proyecto Gil, desperezado el descanso veraniego, se pone en marcha, el 25 de julio de 1989, en el Estadio del Manzanares con la presentación del equipo y el entrenador que lo van a defender. Abel, Elduayen, Mejias, Tomas, Goicoechea, Donato, Solozabal, Ferreira, Pizo Gómez, Torrecilla, Abadia, Alfredo, Bustingorri, Marina, Orejuela, Aguilera, Baltasar, Manolo, Futre, Sergio, Luis García, Armando y Marcos. Con el entrenador Javier Clemente, son novedad, el navarro Bustingorri, procedente del Club Atlético Osasuna, Abadia del Logrones, Pachi Ferreira del Athletic de Bilbao formidable jugador, que posee la estimable condición de encontrarse siempre en buena forma y Pizo Gómez del Osasuna casta, pundonor y lo que hay que tener. En el Trofeo Ciudad de La Línea, el 5 de agosto de 1989 Javier Clemente se estrena en el banquillo del Atlético de Madrid. Una nueva e inmensa Copa, para los anaqueles rojiblancos. El Atleti y el Sevilla dan cuenta del Slova de Bratislava y el brasileño Palmeiras, tercero y cuarto clasificados del torneo linense. El día 6, en la final, el Atlético de Madrid vence al Sevilla C.F. por uno a cero. El próximo envite lo tienen los rojiblancos en La Coruña, donde disputan el Trofeo Teresa Herrera. El 12 de agosto, el Atlético de Madrid vence por cinco goles a uno al Liverpool. El día 14, pierde por tres a uno con el P.S.V. Eindhoven. Sin abandonar Galicia, el Atlético de Madrid participa en el Trofeo Triangular Ciudad de Vigo. El 18 de agosto, el Benfica, que seria el vencedor de la Competición, gana por uno a cero a los rojiblancos. El 19 de agosto, el Real Club Celta se apunta la victoria frente a los colchoneros por tres goles a uno. El ya tradicional Trofeo Villa de Madrid se juega los días 21, 22 y 23 de agosto. En esta ocasión el Trofeo se presenta estilizado, mas esbelto, bello y valioso. Campeonato relámpago y triangular con tres conjuntos de lujo. El Dynamo de Bucarest vence por tres a uno al Tottenhan. El Atleti gana uno a cero al Dynamo y por el mismo tanteo al equipo ingles, proclamándose triunfador. El Trofeo Carranza lo disputan, los días 26 y 27 de agosto, Vasco da Gama, Atlético Minero, Atlético de Madrid y Cádiz. Los rojiblancos madrileños pierden por uno a cero ante el Vasco de Gama. Para el tercer puesto de la clasificación vencen por uno a cero al Cádiz C.F. El Atlético Madrileño, flamante nuevo Segundo División A, tras su ascenso se enfrenta en partido amistoso con el equipo uruguayo Danubio de Montevideo. Al terminar el encuentro en tablas se decide el vencedor por penaltys acompañando el acierto a los cachorros rojiblancos. El Atlético de Madrid inicia la Liga, el 2 de septiembre de 1989, con triunfo en Valencia por tres goles a uno. La Copa de la UEFA, la comienza el 9 de septiembre, frente a la Fiorentina en el Estadio del Manzanares, apuntándose la victoria por uno a cero, gol marcado por Baltasar. Acuden los rojiblancos llenos de ilusión al Estadio Renato Curi, de Perugia, donde La Fiorentina celebra sus partidos eventualmente mientras remodelan su Estadio. La víspera del encuentro, sucede algo extraño. Los técnicos del Atlético comprueban que los italianos han variado las medidas del área, ampliadas al máximo y han estrechado las líneas laterales reduciendo el terreno de juego. El 27 de septiembre, día del encuentro, aparece un "fantasma", tradicionalmente casero, fuera de edad y de forma física, el arbitro francés Voutrot. Brava pelea del equipo colchonero que defiende la diferencia del gol de Madrid. El italiano Bruno marca y nivela la eliminatoria. La hinchada, los tifosis vociferantes alentando a los suyos sin pausa en los ataques italianos, mientras da resultado el buen control del juego por parte del Atlético. A partir del empate, el colegiado galo comienza a pitar a destiempo, siempre paralizando la acción rojiblanca. Culmina su despropósito expulsando injustamente a Goicoechea, cuando la proeza esta en marcha. Como el periodo adicional termina sin nuevos goles, se recurre al cara y cruz, que supone los penaltys. Los rojiblancos llevan la peor parte y quedan eliminados. Por el Atlético de Madrid saltaron al campo, Abel; Pizo Gómez, Tomas, Sergio, Goicoechea, Bustingorri; Ferreira, Donato, Orejuela; Baltasar y Futre. Los jugadores Marina y Ferreira también tuvieron su oportunidad. Con la actuación en la Liga renace la esperanza, el Atlético marcha en los puestos de cabeza. Un infortunado accidente de automóvil en la autovía urbana madrilena M-30, el 3 de octubre, siega la vida de Jesús García Pérez, guardameta del Atlético Madrileño. Suceso fatal que ha truncado muchas ilusiones de una carrera deportiva que apuntaba alto. En el partido Real Zaragoza, Atlético de Madrid, celebrado, el 8 de octubre, en el Estadio del Manzanares se guarda un minuto de silencio en memoria del desafortunado jugador. El contrato de García Pérez extinguido por su muerte, lo respeta el presidente Jesús Gil en favor de los padres del desaparecido jugador, por los tres años de duración del mismo. El miércoles, 9 de noviembre de 1989, festividad de la Virgen de la Almudena, Patrona de Madrid y del Club Atlético, en el Estadio del Manzanares disputan el primer encuentro de cuartos de final de la Copa, el Real Madrid y el Atlético de Madrid, arbitrado por el colegiado Ramos Marcos con las cámaras de televisión por testigo. Por el Atleti juegan Abel; Tomas, Ferreira, Donato, Armando; Pizo Gómez, Abadia, Alfredo; Manolo, Baltasar y Futre. Por el Real Madrid, Buyo; Julio Llorente, Ruggeri, Sanchis, Esteban; Parra, Michel, Aldana; Hugo Sánchez, Butragueño. El empate a cero con que termina el partido no refleja lo ocurrido sobre el césped. Los rojiblancos demuestran superioridad con excelente juego. La extraordinaria actuación de Buyo, todo un valladar, tiene la culpa del cero en su portería, de manera que después del encuentro es felicitado por el Presidente del Atleti, Jesús Gil. Otra parte de ese marcador intocable corresponde al arbitro, que no sanciona una entrada en falta, dentro del área, de Julio Llorente a Futre, clarísimo penalty, como delata la repetición de la jugada en televisión. El colegiado pita todas las faltas en el centro del terreno a favor de los rojiblancos, en las otras zonas se inhibe. Consiente las asperezas de Hugo Sánchez y las deliberadas perdidas de tiempo de Buyo. El diario madrileño "AS", en la reseña del partido dice, "es un mal colegiado y se empeña en demostrarlo públicamente". La masa rojiblanca muestra su enfado y exclama: "Basta de atropellos!." Surge la propuesta de que el equipo del Atlético no se presente a jugar el partido de vuelta en el Estadio Santiago Bernabeu. Esta no se lleva a efecto y se disputa el encuentro, que gana el Real Madrid por dos a cero, debido al oportunismo de Hugo Sánchez. Antes de que finalice el año 1989, es nombrado Vicepresidente del Club Atlético de Madrid Jesús Gil Marin, experto economista. Gil Marin declara que "si, se depende tal gol, y lo que hay que conseguir son goles, cuando no existe esa dependencia, y se niega a entrar el balón, todo se viene abajo." "En el Club hay que arbitrar otros medios para salir adelante económicamente". 'Fundamentalmente creo en mi padre. A partir de ahí, creo en el 'proyecto Gil', que tiene que funcionar". Echa a rodar el calendario de 1990, y el 6 de enero, el Atlético visita el Estadio Bernabeu, en partido de la primera vuelta de la Liga, que termina tres a uno a favor de los madridistas. Estos alinean a Buyo; Chendo, Hierro, Ruggeri, Sanchis; Michel, Schuster, Martín Vázquez, Gordillo (Paco Llorente); Hugo Sánchez, Butragueño (Solana). Por el Atleti; Elduayen; Tomas, Ferreira, Solozabal, Armando; Pizo Gómez, Donato, Alfredo, Bustingorri; Manolo y Futre. Arbitra Enrique Negreira y el partido en esta ocasión transcurre por causas normales. En la jornada XIX de la Liga de 1989-1990, el 14 de enero de 1990, en el Estadio del Manzanares, el Atleti gana por tres a uno al Sporting de Gijon. Simon Marina protagoniza la efemérides del día al marcar el gol TRES MIL del Atlético de Madrid en la Liga, oportunidad que se le presento a este formidable jugador internacional, que no ocurre todos los días.