In den 80er und 90er Jahren des 16. Jahrhunderts fand eine Rückwanderung der niederländischen Flüchtlinge in ihre Heimat statt, da die Spanier sich aus den wichtigsten Zentren im Norden der Niederlande zurückgezogen hatten (Schöningh, 1974, S. 14). Dies hatte für die Stadt Emden zur Folge, dass die niederländischen Häfen wieder verstärkt ihre Handelsfunktionen aufnahmen. „Emden blieb nicht mehr der konjunkturbegünstigte Ausweichhafen“ (Eichhorn, 1974, S. 6).

Um die Wende des 16. Jahrhunderts veränderten sich die Emder Hafenverhältnisse. Eine starke Sturmflut, die einen erneuten Dollarteinbruch zur Folge hatte, führte dazu, dass die Ems ihr Flussbett in Richtung Süden verlagerte. Durch die Erweiterung des Dollarts „verließ der Strom nach und nach seine unter den Mauern der Stadt entlang führende Schleife“ (Eichhorn, 1991, S. 9). Die ehemalige Emsschleife, die sich in die Emder Bucht verwandelte, drohte zu versanden. Die Zufahrt zum Emder Hafen wurde immer schwieriger. Dadurch waren die Erhebung der Emszölle und die Weiterführung des Stapelrechts gefährdet (vgl. Claudi, 1982, S. 151). Die Stadt suchte nach einer Lösung, um die Ems wieder in ihr altes Flussbett zu „zwingen“. Eine 4,5 km lange Eichenspundwand, das „Nesserländer Höft“, wurde gebaut, um den neu entstandenen Flussverlauf abzuriegeln und den Fluss in seinen alten Verlauf zu bringen. Dieses Projekt erwies sich aber als zu kostspielig. Rund 50 Jahre später musste das teure Bauwerk aufgegeben werden, „weil die Unterhaltsarbeiten die in dieser Zeit zurückgehende wirtschaftliche Kraft Emdens überschritten“ (Kramer, 1967, S. 26). Die Ems floss nun ca. 3 km vom alten Innenstadthafen entfernt in einem neuen Flussbett.