ストーリー紹介（７話以降）
第七話
Revelations part
1:Discovery
サイバトロンはスラストのバイク部隊に追われている
コンボイが撃退する
あまり役に立てないとラットルは落ち込む
サイバトロンはスパークの抜けたトランスフォーマー達の体を見つける
そしてスパークはまだどこかにある筈だと言う
サイバトロンはベヒコンに襲われる
危機に陥ったブラックウィドーを何故かスラストが助ける
もうすぐ一帯は爆発すると言う。 この状況を引き起こしたコンボイをチータスは責める
スラストはブラックウィドーを助けたのは間違いだったと言う
ブラックウィドーを助けようとコンボイは奮戦するが、チータスは撤退すべきだと言う
電車に轢かれそうになったブラックウィドーをスラストはまたも助ける
その際シルバーボルトの映像が映る
スラストは何かを思い出しそうだと言う
そして彼の記憶にはブラックウィドーが
スラストとブラックウィドーはスパーク摘出工場に迷い込む
スパークを摘出されそうになったブラックウィドーをスラストが自分を犠牲にして助ける
その際ブラックウィドーはシルバーボルトの姿を見る
ブラックウィドーはスラストを助ける
ナイトスクリームはタンコアのエネルギーを吸い取る
ジェットストームにやられそうになったコンボイはチータスに助けられる
ナイトスクリームはコンボイの指揮能力が低下しているとしてチータスに指揮を取るように言うがチータスは拒否
ブラックウィドーはスラストの記憶を戻そうとする
そこにサイバトロンが乗り込んできて、スラストは逃げる
コンボイはセイバートロンの住人のスパークが抜き取られたのはメガトロンを止められなかったからだと自分を責める
呆けてるコンボイに代わってチータスが退却命令を出す
チータスはコンボイの指揮を信用出来なくなり、これからは自分が指揮を取ると言う
スラストが逃げたのはコンボイが乗り込んできたからだとブラックウィドーは責める。 しかしスラストとシルバーボルトの事は話していない
もしスラストが元サイバトロンなら、タンコアとジェットストームもその可能性があるので倒すことは出来ない
第八話
Revelations part 2:
Descent
コンボイは森が機械化する夢を見る
悪夢にうなされるコンボイをサイバトロンが起こす
しかしコンボイはあと少しでオラクルがサイバトロンをリフォーマットした理由が判る所だったと言い、サイバトロンを責める
コンボイはしばらく一人にして欲しいと言い、サイバトロンは不信感を抱く
チータスはVehiconをサイバトロンに戻そうと作戦を立てる
ブラックウィドーはスラストから始めようと言うが、チータスは鈍いTankhorから始める事を提案する
ブラックウィドーはスラストと話そうとするが、ナイトスクリームに邪魔をされる
スラストはまたもシルバーボルトかのような行動を起こす
ブラックウィドーはスラストに過去を思い出させる
その記憶にはブラックウィドー,そしてサイバトロンの姿が
ブラックウィドーはスラストがシルバーボルトだと確信する
ラットルはTankorを捕獲して記憶にアクセスする
するとサイバトロンの宇宙船のイメージが
ラットルはTankorにアクセスするとなぜか自分の失った記憶が見えると結論付ける
（以下過去の記憶）
そのイメージによると、メガトロンは宇宙船から逃げ出したらしい
そして宇宙船はセイバートロンからの砲撃で撃ち落とされた
サイバトロンはVehiconの攻撃でメタルズの体を失う
そこにはラットルの姿も
ラットルが写っているなら、この記憶は彼の物ではない
ではラットルが見ているのは誰の記憶か？
ラットルが更に記憶を引き出すと、Vehiconのバイザーに反射した姿は、、、
ライノックス！！
（過去の記憶以上）
Tankorのスパークはライノックスの物だった
スラストは忠誠を示すためブラックウィドーのスパークを抜き取る
ナイトスクリームに邪魔をされたが、ジェットストームがスパークを抜き取る
第九話
Revelations part ３:Apocalypse
コンボイはオラクルから自分の役目を聞き出そうとする
サイバトロンの機械化を止める術がわからないコンボイは苦悩する
チータスとラットルはライノックッスをTankorから呼び戻そうとする
一時はライノックスの意識が回復するも失敗
ナイトスクリームはジェットストームと戦う
スラストはブラックウィドーの体をどこかに運ぼうとするがナイトスクリームに邪魔をされる
ブラックウィドーのスパークはオラクルを通じてコンボイに出会う
ナイトスクリームはスラストを倒してブラックウィドーのスパークを手に入れる
そしてそれを体に戻そうとするが、スパークはパニックを起こして逃げてしまう
コンボイの説得でスパークは体に戻る
チータスの説得でライノックスの意識がまた目覚める
コンボイはライノックスのスパークにアクセスして説得を試みる
しかしライノックスは争いが終わらないのは個人個人が自分勝手な意思を持っているせいで、メガトロンは正しいと言う
Tankorの体にいる間ライノックスは全てを見ていた
そしてメガトロンこそがセイバートロンの未来だと気づいた
サイバトロンは無理やりTankorのプログラムを変更しようとする
しかしコンボイが止める
コンボイはライノックスの意思を尊重し、プログラムを変更するだけではメガトロンとなんら変わりないと言う
Tankorはその場を去る
コンボイはマトリクスからサイバトロンの使命を聞き出した
彼らが地球に送られたのはビーストモードとして有機物を持ち帰るため
そしてその有機物を使って有機と機械の共存する世界を作る事がマトリクスの意思
第十話
Ｓｕｒｖｉｖａｌ
有機を体から排除できないメガトロンはいらつく
メガトロンはナイトスクリームが完全有機であることに注目し、メガトロンの体から有機を消し去るヒントがあるかもしれないと思う
メガトロンはナイトスクリームの捕獲を命じる
サイバトロンは、ナイトスクリームがどこから有機のＤＮＡをスキャンしたのか不思議がる
コンボイは「未来の種」を手に入れる
サイバトロンはＶｅｈｉｃｏｎの攻撃を受ける
ナイトスクリームがＶｅｈｉｃｏｎに囚われる
ナイトスクリームは全有機な為、肉体の再生が早い
それを応用すればメガトロンは全機械になれると言う
ナイトスクリームはＶｅｈｉｃｏｎから逃げ出す
Ｔａｎｋｏｒはライノックスの記憶が覚醒したため知性を得る
彼曰く、ライノックスと昔のＴａｎｋｏｒが融合した物らしい
Ｔａｎｋｏｒはサイバトロンには有機を持たない者のリーダーシップが必要だと言い、メガトロンに反逆を起こす決意をする
Ｔａｎｋｏｒは作業用ロボットを見方につける
ナイトスクリームはコウモリの化石を発見する
彼のＤＮＡはそこから取られた物だった
他にも化石が沢山見つかる
これセイバートロンにかつて有機物が存在していた証拠
ナイトスクリームは自分だけがメガトロンのウィルスを逃れられた事に罪悪感を感じる
コンボイは「未来の種」をまく
メガトロンはナイトスクリームが捕らえられなかった事に怒る
第１１話
Ｔｈｅ Ｋｅｙ
Ｔａｎｋｏｒはベクターシグマの鍵を手に入れようとするがサイバトロンのスパークを持っていないため阻まれる
そこでスパークを持たない作業用ロボットを使って鍵を手に入れる
Ｔａｎｋｏｒがサイバトロンの基地に乱入してくる
そして鍵から光線を出す
するとそれはナイトスクリームに当たってしまう
しかしＴａｎｋｏｒは突然苦しみ出し、鍵の力がオバーロードしたと言って倒れてしまう
そして戦車部隊に回収される
ナイトスクリームは鍵の影響で機械化して凶暴になってしまう
機械化は地面から湧き出す生命の元によって中和されるが、量が足りなく、ナイトスクリームはまた機械化してしまう
この事態を打開するためブラックウィドーを監視に残してサイバトロンはメガトロンの本拠地に乗り込む
チータスはコンボイのリーダーシップに疑問を持ちなにかと反発する
サイバトロンは乗り込んだところでメガトロンの手下に襲われる
その中には巨大なドリルもあった
その間にブラックウィドーはナイトスクリームに触られ、機械に感染してしまう
コンボイはドリルを利用し地面を掘らせ、生命の元を溢れさせる
そしてブラックウィドーとナイトスクリームも癒される
しかしチータスとコンボイの間にしこりはのこったまま
第１２話
Ｔｈｅ Ｃａｔａｌｙｓｔ
コンボイはライノックスの事を思いながら未来の種をまく
メガトロンはＴａｎｋｏｒが本当に死んだのか疑っている
作業用ロボットはＴａｎｋｏｒに操作されてメガトロンを騙そうとする
メガトロンは作業用ロボットも疑わしい目で見る
ブラックウィドーはスラストを元の姿（シルバーボルト）に戻すため生命の元を持ち出す
作業用ロボットはＶｅｈｉｃｏｎをサイバトロンの居ない方向に誘導する
ラットルは生命の元の効果を推進させるプログラムを開発
しかしこの影響で森が育ちすぎる
ブラックウィドーはＶｅｈｉｃｏｎに遭遇する
チータスはラットルのプログラムによって成長力が増大した植物こそメガトロンへの兵器になると主張
しかしコンボイはそれがマトリクスの意思と違うと却下
ナイトスクリームはコンボイが本当に正しいのか疑う
コンボイはオラクルに会いに行く
その間チータスにリーダーを任せるが、なにも目立った行動はするなと釘をさす
ブラックウィドーはついにスラストのコアに生命の元をかけることに成功する
そしてスラストは正体を取り戻す
そう、そこに現れたのは、、、、
ワスピーター！！！！
ワスピーター曰く、彼はセイバートロンが恋しくて帰って来たのだという
しかし、本当は地球の原住民に追い出されただけだった
もうヤラレ役でないと、ワスピーターは喜んでいる
ワスピーターはブラックウィドーに交際を申し込むが断られる
そこにジェットストームが乱入
その際ブラックウィドーの持っていた生命の元が彼のコアにかかる
そして現れたのは、、、、、、
シルバーボルト！！！！
性格は相変わらずキザである
ラットルはサイバトロンにブラックウィドーが出ていった事を打ち明ける
コンボイはマトリクスへのアクセスを拒否される
シルバーボルトとスラストはＶｅｈｉｃｏｎに攻撃されたショックでＶｅｈｉｃｏｎに戻ってしまう
サイバトロンはチータスはリーダーとして、急激に成長する植物を使ってブラックウィドーを助ける
Ｔａｎｋｏｒはベクターシグマの鍵を作動させる
そして機械化は植物を伝って広まる
何とか植物を切断して基地は守られた
コンボイとチータスはまた激突
メガトロンはベクターシグマの鍵のプログラムは全部隊に組み込む様命令する
しかし、作業用ロボットはジェットストームとスラストが謀反を起こした時の事を考えて戦車部隊にのみ装備する事を進める
メガトロンはそれを受け入れる
第１３話
End Of The Line
ラットルとチータスは戦車部隊に襲われるがラットルの新兵器で撃退
この新兵器は機械を有機物に変えると言う
全ての戦車部隊はベクターシグマの鍵を装備する
しかし何故かTankorの命令を聞かない
コンボイはオラクルから最終決戦だとの声を聞く
コンボイはメガトロンを倒す方法をオラクルから聞いたと言う
しかしコンボイが聞いたオラクルの声はTankorに作られた偽者だった
サイバトロンは偽オラクルから聞いたプラズマエネルギーと言う兵器を見つける
プラズマエネルギーは機械のシステムをオーバーロードさせて完全に消し去ると言う
しかし生物には無害
コンボイは（偽）オラクルからダウンロードしたプログラムでプラズマエネルギーを制御できる
そしてコンボイはセイバートロンから全ての機械を消し去ると言う
これがオラクルの意思だと言うが、チータスはオラクルを信用できないと言う
チータスは、全ての機械を消し去ればコンボイもメガトロンもやっている事は変わらないと言う
そしてコンボイはチータスに作戦を提案させる
その提案は、ラットルの新兵器で戦車部隊を足止めしている間にラットルがコンピューターにアクセスしてメガトロンの弱点を探ると言うもの
コンボイは同意
Tankorはコンボイがプラズマエネルギーを性格的に使えない事を計算していた
メガトロンはプラズマエネルギーの存在に恐怖を覚える
そしてベクターシグマの鍵を全て使う事決定する
メガトロンのコンピューターにアクセスしていたラットルはTankorにやられてしまう
メガトロンはTankorの企みに気付き始める
コンボイはメガトロンと一騎打ち
コンボイは次々とサイバトロンのメンバーが機械化してしまうのを見せ付けられる
しかしコンボイは、オラクルの意思は共存だとしてくじけない
ついにメガトロンはビーストモードで戦ってしまう
コンボイはメガトロンはリフォーマットしようとする
しかしTankorに撃たれる（ベクターシグマの鍵で？）
そしてTankorはメガトロンにもベクターシグマの鍵を発射する！
はずだったが、突然動けなくなる
メガトロンは全ての部下に、反逆すると自由を奪うプログラムを入れていた
メガトロン曰く、Tankorの行動は全て計算ずくだったと言う
ぼろぼろのコンボイはプラズマエネルギーを発動させてしまう！
メガトロンも全てのベクターシグマの鍵を発射する！
そしてセイバートロンは、、、、