Inu-Yasha kertoo nuoren Higurashi Kagomen aikamatkailusta vanhaan Japaniin. Sankarittaremme vedettiin erään demonin takia Kagomen asuintalon vieressä olevaan kaivoon, jonka kautta Kagome tupsahtaa vanhaan aikaan. Siellä hän tapaa Inu-Yasha-nimisen pojan, jonka Kagomen entinen minä, papitar Kikiyo, on sinetöinyt puuhun. Kagome vapauttaa Inu-Yashan puusta, ja tämä hyökkää tytön kimppuun. Kagomen väistellessä Inu-Yashaa, hänen ruumiistaan vedetään esiin "Shikon no Tama"-niminen pieni kivi, joka voi toteuttaa niin ihmisen kuin demoninkin kaikki toiveet. Kun Kagome ja Inu-Yasha sitten yrittävät saada sitä takaisin, se vahingossa särkyy ja levittäyttyy ympäri Japania. Ja eihän siinä muu auta sitten kuin kerätä kaikki palat, jottei mitään pahaa tapahtuisi.