ตามพระราชพงศาวดารกล่าวถึงวัดนี้ว่า เป็นวัดที่สมเด็จพระเอกาทศรถ ทรงสร้างขึ้น
เมื่อปี พ.ศ. ๒๑๔๘ เพื่อเป็นที่บรรจุ พระบรมอัฐิ ของ สมเด็จพระนเรศวร มหาราช พระเชษฐา ซึ่งเสด็จ สวรรคต ที่เมืองหาง ครั้งยกทัพไปตีเมืองตองอู เป็นวัดขนาดเล็ก ในปัจจุบันหลังจาก ได้มีการบูรณะซ่อมแซมโดยกรม ศิลปากรเมื่อ ปี พ.ศ. ๒๕๓๓ พระพุทธรูปประธาน ภายใน พระอุโบสถวัดวรเชษฐาราม รอบๆ บริเวรวัดแห่งนี้ ยังคงปรากฏให้เห็นซากโบสถ์ วิหาร
พระพุทธรูป และ เจดีย์ประธาน ซึ่งเชื่อว่าเป็นที่บรรจุ พระบรมอัฐิ ของสมเด็จพระนเรศวรมหาราช
เจดีย์ประธานของวัดวรเชษฐาราม ที่เป็นที่บรรจุพระบรมอัฐิของ สมเด็จพระนเรศวรมหาราช
