Mikroskopide gram boyamayla nötrofillerle gram negatif diplokoklar(Neisseria menengitidis) gösteriliyor.Gram boyama ve kültür lumbar ponksiyonla alınmış serebro spinal sıvı materyali ile yapılır.Menengit nedeni farklı bakteriler olabilir ama bunlar genelde bilinen bir kaç türdür ve yaş gruplarında belirli organizmaların görülmesi daha olasıdır.
ORGANISMPEAK AGE INCIDENCEGRAM STAIN
Escherichia coliNeonatlarGram negatif basiller
Hemophilus influenzaeInfantlar  ve çocuklarGram negative coccobasil
Neisseria meningitidisAdolesan ve genç erişkinlerGram negatif diplokok
Streptococcus pneumoniaeYaşlılar yada çocuklarGram pozitif  zincirli kok