O último episódio de Tenchi in Tokyo começa com a família Masaki reunida no castelo de Yugi. A vilã está chocada, pensando que Sasami, a única pessoa que sorriu pra ela e a chamou de amiga, a traiu. Sasami pede que Yugi desista de seus planos malignos. Yugi pede que Sasami volte, mas a princesinha se recusa. Rejeitada, Yugi perde a paciência e destrói tudo, incluindo sua serva Mattori.
Felizmente, Aeka protege todos com seu escudo. O lugar se transforma num local desolado, a verdadeira face de Yugi.
A vilã se recolheu no seu castelo. As garotas estão prontas para enfrentá-la, mas Tenchi deseja lutar sozinho, já que ele é responsável por tudo isso. As garotas aceitam a decisão do rapaz e lhe entregam os cristais. Tenchi reúne os sete cristais, forma sua espada mística e corre até o castelo. Mas as garotas decidem dar cobertura ao rapaz.
Quando Tenchi está correndo para o castelo, Yugi decide invocar criaturas de cristal para detê-lo. Porém as garotas surgem para limpar o caminho. Enquanto todos lutam, Washu permanece com Sasami. Ela se lembra de uma conversa que teve com Katsuhito. O sacerdote diz que seu neto pode vencer os inimigos sem precisar enfrentá-los. Além disso, Tenchi conseguiu transformar duas perigosas criminosas espaciais em aliados (Washu e Ryoko). Washu, porém, está cética, e acredita que Tenchi atacará Yugi.
Tenchi finalmente chega a entrada do castelo. Desesperada, Yugi tenta fechá-la com uma parede de cristais, mas é destruída por Ryoko. As garotas ficam esperando do lado de fora, enquanto Tenchi entra sozinho.
Lá dentro, Tenchi encontra Yugi, assustada e chorando. Ela implora pra não seja aprisionada novamente e tenta repelir Tenchi com uma rajada de energia, mas o ataque é facilmente bloqueado pela espada. Tenchi anda em sua direção, pronto pra acabar com tudo. Quando todos pensavam que ele iria atacá-la, Tenchi surpreende: ele larga a espada e dá um tapinha no rosto de Yugi. Sua armadura cai e Tenchi pousa a garotinha gentilmente no solo. Tenchi acredita na bondade de Yugi e a convida pra fazer de sua família, tendo sempre a companhia de Sasami. O mundo volta completamente ao normal. Yugi cai no ombro de Tenchi e murmura que se sente muito cansada. Tenchi novamente venceu sem precisar lutar.
Tempos depois, Tenchi e as garotas estão juntos novamente. Em Okayama, Tenchi recebe uma carta de seus antigos colegas de classe (assinada como "suas namoradinhas de Tóquio", o que deixa as garotas desesperadas). Sasami faz uma visita a Yugi, que dorme na caverna do Templo Masaki. Yugi preferiu ficar dormindo até se transformar numa pessoa melhor.
Ryoko está aproveitando um momento a sós com Tenchi na floresta. Ela lembra que se Sakuya é a sombra de Yugi, então Yugi pode crescer e se tornar uma Sakuya? Ryoko resolve perdoar o Tenchi por sair com outra mulher, contanto que ele lhe beije. Esse momento romântico é interrompido com a aparição de Washu (testando novamente seu túnel interdimensional) e do restante da família. A vida do Tenchi volta ao normal caos de sempre.
Em Tóquio, os antigos colegas de Tenchi sentem saudades do rapaz. Embora tenha ficado pouco tempo na cidade, eles nunca se esquecerão do Tenchi.

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