Hidrojen atomu bir elektronu oldugu halde bazi bilesiklerde (suda) iki bag olusturur. Bunlardan birincisi kovalent bagdir. Hidrojen baginda görülen ikinci atomun çekilmesi ise daha çok iyonik kuvvetlerden kaynaklanir. O-H....O gösteriminde O-H kovalent bag, H....O ise daha uzun ve zayif hidrojen bagidir. Bu bagin olusmasi, hidrojen atomunun küçük olamasindan, iç elektron kabuklari içermemesinden ve dolayisiyla itici kuvvetlerin bulunmamasi sonucunda komsu atomlara yaklasabilmesinden kaynaklanamaktadir. Sadece hidrojen atomu ile elektronegativiteleri büyük olan elementler (N, O, F, S) arasinda hidrojen bagi görülür. Buz, diyaspor, böhmit, terugit, gibsit ve bazi tabakali silikatlarda hidrojen bagi görülür.