El rival en semifinal es Millonarios
El rival del Necaxa en la semifinal de la Copa Merconorte 2001 sera el club Millonarios de Colombia. Los colombianos quedaron primero del grupo 2 tras vencer a los Metrostars de Nueva York Nueva Jersey,  el mismo equipo que le costo la sancion de 2 anos al Guadalajara,  1-0. El grupo 2 dejo al Millonarios de Colombia con 12 puntos y diferencia de mas 3, segundo al Deportivo Italchacao de Venezuela con 12 y diferencia de mas 1, tercero los Metrostars de NY/NJ con 9 puntos, y al fondo las Chivas Rayadas de Guadalajara con 3 puntos. Necaxa jugara el partido de ida en Colmbia el 28 de Noviembre del 2001, un dia antes que la otra semifinal. El partido de vuelta se jugara como lo an jugado durante toda la Merconorte, en el Municipal de Aguascalientes el 5 de Diciembre. El actual campeon de esta copa es el Atletico Nacional de Colombia.