PAH
Микросателлитный тетрануклеотидный повтор (TCTA)n в 3-м интроне гена
фенилаланингидроксилазы (PAH, хромосомная локализация 12q22-12q24.2,
GDB:118671). Нумерация аллелей не отражает число содержащихся в них тандемных повторов. В различных популяциях показано
существование 9 аллелей (аллели 1 - 9).
Первоисточник:
Goltsov A.A., et al. (1993) A single polymorphic STR system in the human phenylalanine hydroxylase
gene permits rapid prenatal diagnosis and carrier screening for
phenylketonuria. - Hum. Mol. Genet. 2, 577-581.
Референтная последовательность ДНК: L10105
Условия амплификации
| 1 цикл | Первая денатурация при 96°C | 2 мин |
| 30 циклов | денатурация при 94°C | 20 сек |
| отжиг праймеров при 55-58°C | 20 сек | |
| синтез цепи при 72°C | 20 сек | |
| 1 цикл | Последний синтез цепи при 72°C | 5 мин |
Данное количество циклов обеспечивает устойчивые воспроизводимые результаты (электрофоретические аллельные полосы удовлетворительной интенсивности без переработки неспецифических продуктов реакции) при внесении в реакционную смесь 5-50 ng очищенной ДНК человека.
| Окрашенный серебром ПАГ 1 – амплификация 20 нг К562 ДНК, нанесение 2 мкл постреакционной смеси на дорожку геля 2 – PAH-STR аллельная "лестница", нанесение 6 мкл на дорожку геля | Разделение продуктов реакции необходимо проводить в полиакриламидных гелях
(например, неденатурирующие ПАГ 8-12%T, 5%C, длина геля не менее 15 см). Наносится 1-5 мкл пост-реакционной смеси на дорожку геля и 5-6 мкл поставляемых в наборе аллельных "лестниц". |
 | Аллельная "лестница" включает аллели: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8. Генотип К562 ДНК - 4/6. |
Частоты аллелей в русской популяции* приведены здесь
* Рассчитаны для объединенной выборки (187 неродственных человек) из городских популяций Москвы и Западной Сибири (Томск, Новосибирск). Консервативная оценка аллельных частот (значения в последнем столбце таблицы) рекомендуется для вероятностных расчетов в экспертной практике.
К бельчонку (в начало)