vWFII
В интроне 40 гена фактора фон Виллебрандта (von Willebrand factor, vWF,
хромосомная локализация 12p13.3-12p13.2) расположен полиморфный участок
(позиции 1597..2521 в клоне M25858.1), содержащий множественные копии
тетрануклеотидного тандемного повтора (ATCT)n/(AGAT)n . С помощью метода ПЦР в этом участке выявляется три дистанционированных друг
от друга полиморфных микросателлита. Микросателлит HUMvWFII (GDB:177640, NCBI
Unique ID: 154943) находится в 3'-концевой части полиморфного участка, позиции
2215..2380. В различных популяциях показано существование восьми аллелей.
Первоисточник: Ploos van Amstel H.K., Reitsma P.H. (1990) Tetranucleotide repeat polymorphism in the vWF gene. Nucleic Acids Res., 18, 4957
Условия амплификации
| 1 цикл | Первая денатурация при 96°C | 2 мин |
| 30 циклов | денатурация при 94°C | 20 сек |
| отжиг праймеров при 55-58°C | 20 сек | |
| синтез цепи при 72°C | 20 сек | |
| 1 цикл | Последний синтез цепи при 72°C | 5 мин |
Данное количество циклов обеспечивает устойчивые воспроизводимые результаты (электрофоретические аллельные полосы удовлетворительной интенсивности без переработки неспецифических продуктов реакции) при внесении в реакционную смесь 5-50 нг очищенной ДНК человека.
Для точной идентификации аллелей разделение продуктов реакции по данному локусу необходимо проводить в полиакриламидных гелях (например, неденатурирующие ПАГ 8-12%T, 5%C, длина геля не менее 15 см). На дорожку геля наносится 3-6 мкл пост-реакционной смеси и 5-6 мкл поставляемых в наборе аллельных "лестниц".
 | Электрофореграмма по локусу vWFII 2, 3, 4 - семейный анализ (подтверждение отцовства) 2 – предполагаемый отец; генотип 9/11 3– ребенок; генотип 9/10 4– мать ребенка; генотип 10/14 Генотип К562 ДНК - 13/13. |
Частоты аллелей в русской популяции приведены здесь
К бельчонку (в начало)