世界上最高的丛林位于马哈瓜尔森林的加亚帕斯-马塔赫生态区.在位于瓜亚斯市的曼拉雷斯-楚鲁特自然区有一条湖泊体系,覆盖了面积为一万公顷的区域.

厄瓜多尔以南,是名为马查利亚的国家公园,内有海滩,丛林以及一个包括拉普拉塔岛的海域.拉普拉塔岛是厄瓜多尔主要的旅游景点之一,是鸟类和色彩各异的鱼类的天堂.

通常,这些鸟类和鱼类只有在加拉帕戈斯群岛才能看见.夏季,大量的鲸群从北极涌入到拉普拉塔岛.

位于埃尔奥罗省的普阳戈石林汇集海化石和巨大的直径长3米的石化树干.

世界上最古老的动物生活在这儿，被称为加拉帕戈斯龟已经在此生存了几百年。水陆两栖的鬣蜥等其它爬行动物也共同生活在这个自然博物馆里；在岩石间和蔚蓝的深海内还可以看到海狮、蜥蜴、熔岩鸥和顽皮的企鹅。岛上的大多数鸟类都具有这些岛屿的地方特色.