El primer episodio abre mostrando la fatal batalla entre Kikyo e Inu Yasha por la perla de Shikon. Como resulta de ese enfrentamiento, Kikyo agonizando clava a Inu Yasha en un árbol con una de sus flechas, donde él permanece por 50 años. En el presente es donde conocemos a Aome Higurashi, una moderna niña de 15 años que vive en Tokio con su familia en un templo. El templo está construido cerca de un viejo pozo, llamado el pozo Comedor de Huesos. Mientras ella miraba a su pequeño hermano Sota, Aome es atacada por un demonio centípedo buscando la perla de Shikon. Aome cae en el pozo y antes de comprenderlo, ella está ahora en el Japón feudal. Ahí conoce a Kaede, la hermana de Kikyo. Luego, regresa el demonio centípedo buscando la perla de Shikon que está dentro del cuerpo de Aome. El demonio rasga el cuerpo de Aome, pero no antes de que el furioso Inu Yasha despierte de sus 50 años de letargo.