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BBP
LABORATORY. DOCTORAT |
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...COURS
1 DIPLOMES D'ETUDES SUPERIEURES APPROFONDIES (D.E.S.A):'GESTION ET AMENAGEMENT DES ECOSYSTEMES NATURELS ET ANTHROPISES EN ZONES ARIDES ET EMI-ARIDES', Faculté des Sciences-Semlalia, Université Cadi Ayyad, Marrakech (Morocco). ETUDE, STRUCTURATION ET CONSERVATION DE LA DIVERSITE DES RESSOURCES GENETIQUES. APPORT DES MARQUEURS BIOCHIMIQUES ET MOLECULAIRES. |
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Le cours programmé pour le D.E.S.A porte sur l'étude, la structuration et conservation de la diversité des ressources génétiques. Ces actions font appel à l'utilisation des marqueurs biochimiques et moléculaires, comme moyens de détection de cette diversité. Ainsi, les chapitres suivants sont plus ou moins développés, selon le volume horaire destiné pour cet enseignement. La diversité génétique comme composante
essentielle de la biodiversité. Polymorphisme enzymatique comme moyen d'étude de la diversité des populations. 1.Origines de la variation
détectée par électrophorèse. Des exemples d'application sont souvent donnés sur quelques espèces végétales comme le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.). Pour approfondir les connaissances sur les différentes variantes de l'électrophorèse, il est recommandé de consulter d'autres références TRAVAUX
PRATIQUES Le travail pratique (TP) du D.E.S.A
"GESTION ET AMENAGEMENT DES ECOSYSTEMES NATURELS ET ANTHROPISES
EN ZONES ARIDES ET SEMI-ARIDES" s'effectue sur une durée de 3 jours
et porte sur une thématique en rapport avec les activités de recherche
du Laboratoire de Biochimie et Amélioration des Plantes (BAP). L'organisation
du TP consiste à former 2 groupes d'étudiants (nombre: 4-5) qui seront
chargés, chacun, de traiter un sujet précis relevant de la diversité génétique
des populations. Les deux sujets sont complémentaires l'un de l'autre.
Les résultats obtenus par les 2 groupes seront, ensuite, rassemblées
pour dégager une information générale sur le thème proposé.
5. Ordinateurs pour traiter les résultats
avec le logiciel BIOSYS
1. COLLECTION DU MATERIEL VEGETAL Munis de sachets et d'un bac de glace, les
étudiants visitent la zone de la palmeraie la plus proche du Laboratoire
pour échantillonner les folioles de palmier dattier (1 foliole par arbre).
Le prélèvement concerne au moins 40 palmiers adultes. Les folioles sont
numérotées et conservées dans le bac à glace. D'autre part, les étudiants
effectuent des prélèvements de feuilles sur quelques lots de plants de
palmiers dattier issus de graines provenant de croisements dirigés connus.
Tout le matériel végétal collecté servira dans l'étape d'extraction des
enzymes en vue de l'étude du polymorphisme isoenzymatique.
Les feuilles, préalablement prélevées (environ
0.25 g) sont découpées et broyées dans un tampon de pH déterminé (voir
polycopié). Cette opération est réalisée à froid (mortiers maintenus dans
la glace). Les extraits sont centrifugés. Le surnageant, riche en enzymes,
est conservé à froid juqu'à l'étape d'électrophoèse. Les différents extraits enzymatiques sont
déposés dans des puits aménagés sur les gels de polyacrylamide qui servent
de supports de séparation des isoenzymes. L'électrophorèse
s'éffectue à 180 V dans des conditions non dénaturantes.
Un cryostat permet de maintenir une température proche de 4°C
par circulation d'eau dans la cuve. Une fois l'électrophorèse
est terminée, les gels contenant les isoenzymes séparéees
sont incubés en présence des substrats de différentes
enzymes. Les enzymes étudiées, à titre d'exemples, sont les estérases
(EST), les endopéptidases (ENP) et la glutamate oxaloacétate transaminase
(GOT). TRAITEMENT INFORMATIQUE DES DONNEES. 3 fichiers sont constitués à l'aide de l'éditeur DOS. Ils sont appelés 'pal_grov', 'pal_loc' et 'pal_sem' et permettent, respectivement, de comparer la palmeraiede Marrakech à 13 autres palmeraies Marocain, aux palmeraies de 4 localités et à 11 lots de plants issus de croisements dirigés entre parents connus. Les étudiants saisissent , dans l'ordre, les génotypes des loci Est 1 (pour EST), Got2 pour GOT) et Enp (pour ENP) correspondant à tous les palmiers dattier de la population de Marrakech. Les génotypes des individus d'autres palmeraies out lots de plants (disponibles au BAP) sont ajoutés aux fichiers correspondants. Le logiciel BIOSYS 1 calculera les variables (indices) de la diversité génétique, les coefficients de similarité et distances génétiques, les F-statistiques et les dendrogrammes. LIENS: APERCU SUR LA DIVERSITE GENETIQUE DES PALMERAIES MAROCAINES. (allumer haut-parleurs !) COURS
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PARTIE 2 : MARQUAGE BIOCHIMIQUE
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