A história de Digimon Tamers é diferente das anteriores. Os digiescolhidos, digimons e inclusive as lutas são passadas mais no mundo real do que no Digimundo. O que sabemos sobre a história de Digimon Tamers é que não é uma continuação de Digimon ou Digimon 02, mas sim uma nova série, pois nenhum dos antigos digiescolhidos irá aparecer.
     Nesta nova temporada, os digimons são conhecidos por todos os humanos e também são muito populares, tão populares que inventaram um jogo sobre eles (Digimon Card Game) que é a mania entre a garotada nesta nova época. Os digiescolhidos da vez são Takato, Ruki e Lee, que são ótimos no Digimon Card Game, o digimon de Takato é Guillmon, que na verdade é um desenho do garoto que tomou vida própria. Lee tem um Terriermon, já conhecido por aparecer em Digimon - O Filme, apesar de não ser o mesmo possuído por Wallace, um digiescolhido que só aparece no filme. A menina Ruki possui um Renamon, muito parecido com uma raposa. Ao invés das placas, brasões e digiovos, os novos digiescolhidos usam as cartas do Digimon Card Game para dar poderes aos seus Digimons. Eles fazem o "Card Slash" passando a carta através do novo Digivice, o D-ARC. Algumas cartas apenas aumentam os poderes do Digimon, mas cartas de Digimon usadas com o "Card Slash", fazem com que o Digimon adquira as propriedades do Digimon da Carta. Como por exemplo, quando Ruki usou a carta de Snimon para dar a Renamon as imensas lâminas do Digimon louva-a-deus. Vale lembrar no entanto, que o poder do Card-Slash varia de Digimon para Digimon!